Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUF5

TUBB6, Tubulin beta-6 chain, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB6Q9BUF5 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TUBB6Q9BUF5 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TUBB6Q9BUF5 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TUBB6Q9BUF5 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TUBB6Q9BUF5 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TUBB6Q9BUF5 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TUBB6Q9BUF5 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TUBB6Q9BUF5 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TUBB6Q9BUF5 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TUBB6Q9BUF5 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUBB6Q9BUF5 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUBB6Q9BUF5 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUBB6Q9BUF5 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUBB6Q9BUF5 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUBB6Q9BUF5 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUBB6Q9BUF5 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUBB6Q9BUF5 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUBB6Q9BUF5 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUBB6Q9BUF5 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUBB6Q9BUF5 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUBB6Q9BUF5 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUBB6Q9BUF5 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUBB6Q9BUF5 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUBB6Q9BUF5 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUBB6Q9BUF5 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUBB6Q9BUF5 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUBB6Q9BUF5 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TUBB6Q9BUF5 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TUBB6Q9BUF5 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TUBB6Q9BUF5 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TUBB6Q9BUF5 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TUBB6Q9BUF5 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TUBB6Q9BUF5 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TUBB6Q9BUF5 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TUBB6Q9BUF5 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TUBB6Q9BUF5 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TUBB6Q9BUF5 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TUBB6Q9BUF5 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TUBB6Q9BUF5 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TUBB6Q9BUF5 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TUBB6Q9BUF5 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TUBB6Q9BUF5 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TUBB6Q9BUF5 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TUBB6Q9BUF5 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TUBB6Q9BUF5 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TUBB6Q9BUF5 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TUBB6Q9BUF5 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TUBB6Q9BUF5 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TUBB6Q9BUF5 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TUBB6Q9BUF5 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TUBB6Q9BUF5 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TUBB6Q9BUF5 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TUBB6Q9BUF5 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TUBB6Q9BUF5 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TUBB6Q9BUF5 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TUBB6Q9BUF5 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TUBB6Q9BUF5 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TUBB6Q9BUF5 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TUBB6Q9BUF5 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TUBB6Q9BUF5 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TUBB6Q9BUF5 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBB6Q9BUF5 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBB6Q9BUF5 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBB6Q9BUF5 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBB6Q9BUF5 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBB6Q9BUF5 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBB6Q9BUF5 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBB6Q9BUF5 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBB6Q9BUF5 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBB6Q9BUF5 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBB6Q9BUF5 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBB6Q9BUF5 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBB6Q9BUF5 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBB6Q9BUF5 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBB6Q9BUF5 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBB6Q9BUF5 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBB6Q9BUF5 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBB6Q9BUF5 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBB6Q9BUF5 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBB6Q9BUF5 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBB6Q9BUF5 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBB6Q9BUF5 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBB6Q9BUF5 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBB6Q9BUF5 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBB6Q9BUF5 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBB6Q9BUF5 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBB6Q9BUF5 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBB6Q9BUF5 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBB6Q9BUF5 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBB6Q9BUF5 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBB6Q9BUF5 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBB6Q9BUF5 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBB6Q9BUF5 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBB6Q9BUF5 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBB6Q9BUF5 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBB6Q9BUF5 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBB6Q9BUF5 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBB6Q9BUF5 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBB6Q9BUF5 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBB6Q9BUF5 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms