Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTM1

H2AFJ, Histone H2A.J, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFJQ9BTM1 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2AFJQ9BTM1 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2AFJQ9BTM1 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2AFJQ9BTM1 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2AFJQ9BTM1 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2AFJQ9BTM1 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2AFJQ9BTM1 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2AFJQ9BTM1 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2AFJQ9BTM1 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2AFJQ9BTM1 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2AFJQ9BTM1 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2AFJQ9BTM1 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2AFJQ9BTM1 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2AFJQ9BTM1 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2AFJQ9BTM1 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2AFJQ9BTM1 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2AFJQ9BTM1 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2AFJQ9BTM1 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2AFJQ9BTM1 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2AFJQ9BTM1 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2AFJQ9BTM1 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2AFJQ9BTM1 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
H2AFJQ9BTM1 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2AFJQ9BTM1 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2AFJQ9BTM1 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2AFJQ9BTM1 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2AFJQ9BTM1 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2AFJQ9BTM1 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
H2AFJQ9BTM1 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2AFJQ9BTM1 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
H2AFJQ9BTM1 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
H2AFJQ9BTM1 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2AFJQ9BTM1 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2AFJQ9BTM1 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2AFJQ9BTM1 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2AFJQ9BTM1 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2AFJQ9BTM1 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2AFJQ9BTM1 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2AFJQ9BTM1 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2AFJQ9BTM1 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2AFJQ9BTM1 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
H2AFJQ9BTM1 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2AFJQ9BTM1 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2AFJQ9BTM1 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2AFJQ9BTM1 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2AFJQ9BTM1 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2AFJQ9BTM1 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2AFJQ9BTM1 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2AFJQ9BTM1 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2AFJQ9BTM1 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2AFJQ9BTM1 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2AFJQ9BTM1 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2AFJQ9BTM1 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2AFJQ9BTM1 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2AFJQ9BTM1 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2AFJQ9BTM1 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2AFJQ9BTM1 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2AFJQ9BTM1 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2AFJQ9BTM1 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2AFJQ9BTM1 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2AFJQ9BTM1 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2AFJQ9BTM1 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2AFJQ9BTM1 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2AFJQ9BTM1 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2AFJQ9BTM1 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2AFJQ9BTM1 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2AFJQ9BTM1 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2AFJQ9BTM1 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2AFJQ9BTM1 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2AFJQ9BTM1 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2AFJQ9BTM1 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2AFJQ9BTM1 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2AFJQ9BTM1 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2AFJQ9BTM1 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
H2AFJQ9BTM1 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2AFJQ9BTM1 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2AFJQ9BTM1 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
H2AFJQ9BTM1 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2AFJQ9BTM1 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2AFJQ9BTM1 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2AFJQ9BTM1 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2AFJQ9BTM1 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2AFJQ9BTM1 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2AFJQ9BTM1 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2AFJQ9BTM1 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2AFJQ9BTM1 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2AFJQ9BTM1 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2AFJQ9BTM1 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2AFJQ9BTM1 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms