Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF4

TIMM29, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim29, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM29Q9BSF4 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TIMM29Q9BSF4 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TIMM29Q9BSF4 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TIMM29Q9BSF4 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TIMM29Q9BSF4 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TIMM29Q9BSF4 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TIMM29Q9BSF4 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TIMM29Q9BSF4 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TIMM29Q9BSF4 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TIMM29Q9BSF4 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TIMM29Q9BSF4 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TIMM29Q9BSF4 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TIMM29Q9BSF4 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TIMM29Q9BSF4 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TIMM29Q9BSF4 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TIMM29Q9BSF4 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TIMM29Q9BSF4 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TIMM29Q9BSF4 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TIMM29Q9BSF4 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TIMM29Q9BSF4 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TIMM29Q9BSF4 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TIMM29Q9BSF4 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TIMM29Q9BSF4 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TIMM29Q9BSF4 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TIMM29Q9BSF4 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TIMM29Q9BSF4 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TIMM29Q9BSF4 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TIMM29Q9BSF4 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TIMM29Q9BSF4 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TIMM29Q9BSF4 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TIMM29Q9BSF4 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TIMM29Q9BSF4 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TIMM29Q9BSF4 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TIMM29Q9BSF4 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TIMM29Q9BSF4 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TIMM29Q9BSF4 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TIMM29Q9BSF4 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TIMM29Q9BSF4 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TIMM29Q9BSF4 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TIMM29Q9BSF4 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TIMM29Q9BSF4 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TIMM29Q9BSF4 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TIMM29Q9BSF4 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TIMM29Q9BSF4 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TIMM29Q9BSF4 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TIMM29Q9BSF4 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TIMM29Q9BSF4 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TIMM29Q9BSF4 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TIMM29Q9BSF4 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TIMM29Q9BSF4 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TIMM29Q9BSF4 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TIMM29Q9BSF4 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TIMM29Q9BSF4 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TIMM29Q9BSF4 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TIMM29Q9BSF4 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TIMM29Q9BSF4 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TIMM29Q9BSF4 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TIMM29Q9BSF4 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TIMM29Q9BSF4 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TIMM29Q9BSF4 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TIMM29Q9BSF4 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TIMM29Q9BSF4 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TIMM29Q9BSF4 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TIMM29Q9BSF4 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TIMM29Q9BSF4 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TIMM29Q9BSF4 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TIMM29Q9BSF4 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TIMM29Q9BSF4 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TIMM29Q9BSF4 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TIMM29Q9BSF4 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TIMM29Q9BSF4 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TIMM29Q9BSF4 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TIMM29Q9BSF4 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TIMM29Q9BSF4 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TIMM29Q9BSF4 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TIMM29Q9BSF4 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TIMM29Q9BSF4 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TIMM29Q9BSF4 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TIMM29Q9BSF4 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TIMM29Q9BSF4 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TIMM29Q9BSF4 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TIMM29Q9BSF4 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TIMM29Q9BSF4 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TIMM29Q9BSF4 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TIMM29Q9BSF4 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TIMM29Q9BSF4 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TIMM29Q9BSF4 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TIMM29Q9BSF4 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TIMM29Q9BSF4 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TIMM29Q9BSF4 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TIMM29Q9BSF4 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TIMM29Q9BSF4 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TIMM29Q9BSF4 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TIMM29Q9BSF4 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TIMM29Q9BSF4 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TIMM29Q9BSF4 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TIMM29Q9BSF4 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TIMM29Q9BSF4 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TIMM29Q9BSF4 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TIMM29Q9BSF4 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms