Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT7

C9orf72, Guanine nucleotide exchange C9orf72, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf72Q96LT7 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms