Protein–RNA interactions for Protein: Q96JS3

PGBD1, PiggyBac transposable element-derived protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGBD1Q96JS3 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PGBD1Q96JS3 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PGBD1Q96JS3 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PGBD1Q96JS3 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PGBD1Q96JS3 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PGBD1Q96JS3 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PGBD1Q96JS3 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PGBD1Q96JS3 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PGBD1Q96JS3 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PGBD1Q96JS3 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PGBD1Q96JS3 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PGBD1Q96JS3 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PGBD1Q96JS3 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PGBD1Q96JS3 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PGBD1Q96JS3 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PGBD1Q96JS3 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PGBD1Q96JS3 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PGBD1Q96JS3 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PGBD1Q96JS3 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PGBD1Q96JS3 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PGBD1Q96JS3 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PGBD1Q96JS3 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
PGBD1Q96JS3 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PGBD1Q96JS3 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PGBD1Q96JS3 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PGBD1Q96JS3 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PGBD1Q96JS3 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PGBD1Q96JS3 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PGBD1Q96JS3 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PGBD1Q96JS3 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PGBD1Q96JS3 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PGBD1Q96JS3 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PGBD1Q96JS3 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PGBD1Q96JS3 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PGBD1Q96JS3 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PGBD1Q96JS3 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PGBD1Q96JS3 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PGBD1Q96JS3 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PGBD1Q96JS3 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PGBD1Q96JS3 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PGBD1Q96JS3 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PGBD1Q96JS3 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PGBD1Q96JS3 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PGBD1Q96JS3 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PGBD1Q96JS3 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PGBD1Q96JS3 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PGBD1Q96JS3 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PGBD1Q96JS3 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PGBD1Q96JS3 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PGBD1Q96JS3 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PGBD1Q96JS3 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PGBD1Q96JS3 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PGBD1Q96JS3 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PGBD1Q96JS3 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PGBD1Q96JS3 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PGBD1Q96JS3 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PGBD1Q96JS3 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PGBD1Q96JS3 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PGBD1Q96JS3 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PGBD1Q96JS3 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PGBD1Q96JS3 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PGBD1Q96JS3 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PGBD1Q96JS3 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PGBD1Q96JS3 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PGBD1Q96JS3 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PGBD1Q96JS3 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PGBD1Q96JS3 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PGBD1Q96JS3 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PGBD1Q96JS3 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PGBD1Q96JS3 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PGBD1Q96JS3 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PGBD1Q96JS3 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PGBD1Q96JS3 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PGBD1Q96JS3 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PGBD1Q96JS3 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PGBD1Q96JS3 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PGBD1Q96JS3 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PGBD1Q96JS3 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PGBD1Q96JS3 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PGBD1Q96JS3 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PGBD1Q96JS3 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PGBD1Q96JS3 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PGBD1Q96JS3 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PGBD1Q96JS3 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PGBD1Q96JS3 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PGBD1Q96JS3 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PGBD1Q96JS3 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PGBD1Q96JS3 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PGBD1Q96JS3 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PGBD1Q96JS3 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PGBD1Q96JS3 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PGBD1Q96JS3 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PGBD1Q96JS3 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PGBD1Q96JS3 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PGBD1Q96JS3 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PGBD1Q96JS3 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PGBD1Q96JS3 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PGBD1Q96JS3 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PGBD1Q96JS3 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PGBD1Q96JS3 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms