Protein–RNA interactions for Protein: Q96JH7

VCPIP1, Deubiquitinating protein VCIP135, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCPIP1Q96JH7 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VCPIP1Q96JH7 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VCPIP1Q96JH7 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
VCPIP1Q96JH7 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
VCPIP1Q96JH7 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
VCPIP1Q96JH7 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
VCPIP1Q96JH7 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
VCPIP1Q96JH7 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
VCPIP1Q96JH7 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
VCPIP1Q96JH7 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
VCPIP1Q96JH7 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
VCPIP1Q96JH7 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
VCPIP1Q96JH7 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
VCPIP1Q96JH7 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VCPIP1Q96JH7 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VCPIP1Q96JH7 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
VCPIP1Q96JH7 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
VCPIP1Q96JH7 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
VCPIP1Q96JH7 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
VCPIP1Q96JH7 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
VCPIP1Q96JH7 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
VCPIP1Q96JH7 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
VCPIP1Q96JH7 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
VCPIP1Q96JH7 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
VCPIP1Q96JH7 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
VCPIP1Q96JH7 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
VCPIP1Q96JH7 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
VCPIP1Q96JH7 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
VCPIP1Q96JH7 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
VCPIP1Q96JH7 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
VCPIP1Q96JH7 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
VCPIP1Q96JH7 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
VCPIP1Q96JH7 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
VCPIP1Q96JH7 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
VCPIP1Q96JH7 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
VCPIP1Q96JH7 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
VCPIP1Q96JH7 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
VCPIP1Q96JH7 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
VCPIP1Q96JH7 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
VCPIP1Q96JH7 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
VCPIP1Q96JH7 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
VCPIP1Q96JH7 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
VCPIP1Q96JH7 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
VCPIP1Q96JH7 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
VCPIP1Q96JH7 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
VCPIP1Q96JH7 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
VCPIP1Q96JH7 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
VCPIP1Q96JH7 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
VCPIP1Q96JH7 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
VCPIP1Q96JH7 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
VCPIP1Q96JH7 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
VCPIP1Q96JH7 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
VCPIP1Q96JH7 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
VCPIP1Q96JH7 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
VCPIP1Q96JH7 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
VCPIP1Q96JH7 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
VCPIP1Q96JH7 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
VCPIP1Q96JH7 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VCPIP1Q96JH7 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
VCPIP1Q96JH7 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
VCPIP1Q96JH7 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
VCPIP1Q96JH7 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
VCPIP1Q96JH7 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
VCPIP1Q96JH7 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VCPIP1Q96JH7 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VCPIP1Q96JH7 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
VCPIP1Q96JH7 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
VCPIP1Q96JH7 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
VCPIP1Q96JH7 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VCPIP1Q96JH7 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VCPIP1Q96JH7 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VCPIP1Q96JH7 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VCPIP1Q96JH7 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VCPIP1Q96JH7 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VCPIP1Q96JH7 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
VCPIP1Q96JH7 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
VCPIP1Q96JH7 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VCPIP1Q96JH7 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
VCPIP1Q96JH7 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VCPIP1Q96JH7 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VCPIP1Q96JH7 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
VCPIP1Q96JH7 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VCPIP1Q96JH7 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VCPIP1Q96JH7 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VCPIP1Q96JH7 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VCPIP1Q96JH7 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
VCPIP1Q96JH7 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VCPIP1Q96JH7 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VCPIP1Q96JH7 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
VCPIP1Q96JH7 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
VCPIP1Q96JH7 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VCPIP1Q96JH7 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VCPIP1Q96JH7 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VCPIP1Q96JH7 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
VCPIP1Q96JH7 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
VCPIP1Q96JH7 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
VCPIP1Q96JH7 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
VCPIP1Q96JH7 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VCPIP1Q96JH7 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VCPIP1Q96JH7 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms