Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CDK5RAP3Q96JB5 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CDK5RAP3Q96JB5 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CDK5RAP3Q96JB5 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CDK5RAP3Q96JB5 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CDK5RAP3Q96JB5 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CDK5RAP3Q96JB5 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CDK5RAP3Q96JB5 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CDK5RAP3Q96JB5 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CDK5RAP3Q96JB5 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CDK5RAP3Q96JB5 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CDK5RAP3Q96JB5 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CDK5RAP3Q96JB5 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CDK5RAP3Q96JB5 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CDK5RAP3Q96JB5 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CDK5RAP3Q96JB5 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CDK5RAP3Q96JB5 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CDK5RAP3Q96JB5 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CDK5RAP3Q96JB5 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CDK5RAP3Q96JB5 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CDK5RAP3Q96JB5 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CDK5RAP3Q96JB5 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CDK5RAP3Q96JB5 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CDK5RAP3Q96JB5 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CDK5RAP3Q96JB5 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CDK5RAP3Q96JB5 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CDK5RAP3Q96JB5 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CDK5RAP3Q96JB5 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CDK5RAP3Q96JB5 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CDK5RAP3Q96JB5 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CDK5RAP3Q96JB5 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CDK5RAP3Q96JB5 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CDK5RAP3Q96JB5 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CDK5RAP3Q96JB5 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CDK5RAP3Q96JB5 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CDK5RAP3Q96JB5 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CDK5RAP3Q96JB5 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CDK5RAP3Q96JB5 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CDK5RAP3Q96JB5 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CDK5RAP3Q96JB5 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CDK5RAP3Q96JB5 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CDK5RAP3Q96JB5 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CDK5RAP3Q96JB5 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CDK5RAP3Q96JB5 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CDK5RAP3Q96JB5 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CDK5RAP3Q96JB5 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CDK5RAP3Q96JB5 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CDK5RAP3Q96JB5 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CDK5RAP3Q96JB5 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CDK5RAP3Q96JB5 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CDK5RAP3Q96JB5 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CDK5RAP3Q96JB5 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CDK5RAP3Q96JB5 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CDK5RAP3Q96JB5 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CDK5RAP3Q96JB5 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CDK5RAP3Q96JB5 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CDK5RAP3Q96JB5 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CDK5RAP3Q96JB5 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDK5RAP3Q96JB5 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDK5RAP3Q96JB5 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDK5RAP3Q96JB5 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDK5RAP3Q96JB5 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDK5RAP3Q96JB5 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDK5RAP3Q96JB5 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDK5RAP3Q96JB5 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDK5RAP3Q96JB5 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDK5RAP3Q96JB5 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDK5RAP3Q96JB5 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDK5RAP3Q96JB5 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDK5RAP3Q96JB5 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CDK5RAP3Q96JB5 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CDK5RAP3Q96JB5 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDK5RAP3Q96JB5 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDK5RAP3Q96JB5 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDK5RAP3Q96JB5 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDK5RAP3Q96JB5 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDK5RAP3Q96JB5 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDK5RAP3Q96JB5 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDK5RAP3Q96JB5 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDK5RAP3Q96JB5 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDK5RAP3Q96JB5 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CDK5RAP3Q96JB5 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDK5RAP3Q96JB5 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDK5RAP3Q96JB5 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDK5RAP3Q96JB5 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDK5RAP3Q96JB5 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDK5RAP3Q96JB5 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDK5RAP3Q96JB5 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDK5RAP3Q96JB5 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDK5RAP3Q96JB5 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDK5RAP3Q96JB5 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDK5RAP3Q96JB5 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CDK5RAP3Q96JB5 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CDK5RAP3Q96JB5 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CDK5RAP3Q96JB5 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CDK5RAP3Q96JB5 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CDK5RAP3Q96JB5 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CDK5RAP3Q96JB5 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CDK5RAP3Q96JB5 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms