Protein–RNA interactions for Protein: Q96J65

ABCC12, Multidrug resistance-associated protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC12Q96J65 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ABCC12Q96J65 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ABCC12Q96J65 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ABCC12Q96J65 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ABCC12Q96J65 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ABCC12Q96J65 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ABCC12Q96J65 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ABCC12Q96J65 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ABCC12Q96J65 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ABCC12Q96J65 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ABCC12Q96J65 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ABCC12Q96J65 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ABCC12Q96J65 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ABCC12Q96J65 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ABCC12Q96J65 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ABCC12Q96J65 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ABCC12Q96J65 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ABCC12Q96J65 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ABCC12Q96J65 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ABCC12Q96J65 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ABCC12Q96J65 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ABCC12Q96J65 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ABCC12Q96J65 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ABCC12Q96J65 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ABCC12Q96J65 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ABCC12Q96J65 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ABCC12Q96J65 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ABCC12Q96J65 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ABCC12Q96J65 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ABCC12Q96J65 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ABCC12Q96J65 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ABCC12Q96J65 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ABCC12Q96J65 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ABCC12Q96J65 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ABCC12Q96J65 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ABCC12Q96J65 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ABCC12Q96J65 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ABCC12Q96J65 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ABCC12Q96J65 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ABCC12Q96J65 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ABCC12Q96J65 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ABCC12Q96J65 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ABCC12Q96J65 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ABCC12Q96J65 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ABCC12Q96J65 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ABCC12Q96J65 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ABCC12Q96J65 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ABCC12Q96J65 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ABCC12Q96J65 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ABCC12Q96J65 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ABCC12Q96J65 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ABCC12Q96J65 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ABCC12Q96J65 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ABCC12Q96J65 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ABCC12Q96J65 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ABCC12Q96J65 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ABCC12Q96J65 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ABCC12Q96J65 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ABCC12Q96J65 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ABCC12Q96J65 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ABCC12Q96J65 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ABCC12Q96J65 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ABCC12Q96J65 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ABCC12Q96J65 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ABCC12Q96J65 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ABCC12Q96J65 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ABCC12Q96J65 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ABCC12Q96J65 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ABCC12Q96J65 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ABCC12Q96J65 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ABCC12Q96J65 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ABCC12Q96J65 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ABCC12Q96J65 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ABCC12Q96J65 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ABCC12Q96J65 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ABCC12Q96J65 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ABCC12Q96J65 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ABCC12Q96J65 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ABCC12Q96J65 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ABCC12Q96J65 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ABCC12Q96J65 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ABCC12Q96J65 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ABCC12Q96J65 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ABCC12Q96J65 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ABCC12Q96J65 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ABCC12Q96J65 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ABCC12Q96J65 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ABCC12Q96J65 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ABCC12Q96J65 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ABCC12Q96J65 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ABCC12Q96J65 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ABCC12Q96J65 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ABCC12Q96J65 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ABCC12Q96J65 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ABCC12Q96J65 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ABCC12Q96J65 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ABCC12Q96J65 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ABCC12Q96J65 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ABCC12Q96J65 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ABCC12Q96J65 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms