Protein–RNA interactions for Protein: Q96GF1

RNF185, E3 ubiquitin-protein ligase RNF185, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF185Q96GF1 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
RNF185Q96GF1 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
RNF185Q96GF1 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
RNF185Q96GF1 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
RNF185Q96GF1 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
RNF185Q96GF1 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
RNF185Q96GF1 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
RNF185Q96GF1 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
RNF185Q96GF1 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
RNF185Q96GF1 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
RNF185Q96GF1 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
RNF185Q96GF1 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNF185Q96GF1 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNF185Q96GF1 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNF185Q96GF1 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNF185Q96GF1 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNF185Q96GF1 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNF185Q96GF1 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNF185Q96GF1 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
RNF185Q96GF1 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNF185Q96GF1 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNF185Q96GF1 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNF185Q96GF1 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNF185Q96GF1 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNF185Q96GF1 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNF185Q96GF1 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNF185Q96GF1 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNF185Q96GF1 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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RNF185Q96GF1 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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RNF185Q96GF1 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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RNF185Q96GF1 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNF185Q96GF1 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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RNF185Q96GF1 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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RNF185Q96GF1 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNF185Q96GF1 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNF185Q96GF1 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNF185Q96GF1 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNF185Q96GF1 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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RNF185Q96GF1 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNF185Q96GF1 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNF185Q96GF1 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNF185Q96GF1 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNF185Q96GF1 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNF185Q96GF1 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNF185Q96GF1 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNF185Q96GF1 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNF185Q96GF1 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNF185Q96GF1 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNF185Q96GF1 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNF185Q96GF1 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNF185Q96GF1 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
RNF185Q96GF1 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNF185Q96GF1 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNF185Q96GF1 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNF185Q96GF1 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNF185Q96GF1 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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