Protein–RNA interactions for Protein: Q96F86

EDC3, Enhancer of mRNA-decapping protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC3Q96F86 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EDC3Q96F86 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EDC3Q96F86 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EDC3Q96F86 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EDC3Q96F86 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EDC3Q96F86 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EDC3Q96F86 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EDC3Q96F86 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EDC3Q96F86 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EDC3Q96F86 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
EDC3Q96F86 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EDC3Q96F86 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
EDC3Q96F86 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
EDC3Q96F86 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EDC3Q96F86 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EDC3Q96F86 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EDC3Q96F86 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EDC3Q96F86 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EDC3Q96F86 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EDC3Q96F86 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EDC3Q96F86 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EDC3Q96F86 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EDC3Q96F86 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EDC3Q96F86 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EDC3Q96F86 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EDC3Q96F86 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EDC3Q96F86 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EDC3Q96F86 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EDC3Q96F86 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EDC3Q96F86 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EDC3Q96F86 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EDC3Q96F86 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
EDC3Q96F86 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EDC3Q96F86 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EDC3Q96F86 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EDC3Q96F86 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EDC3Q96F86 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EDC3Q96F86 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
EDC3Q96F86 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EDC3Q96F86 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
EDC3Q96F86 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EDC3Q96F86 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EDC3Q96F86 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EDC3Q96F86 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EDC3Q96F86 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EDC3Q96F86 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EDC3Q96F86 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EDC3Q96F86 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EDC3Q96F86 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EDC3Q96F86 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EDC3Q96F86 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EDC3Q96F86 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EDC3Q96F86 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EDC3Q96F86 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EDC3Q96F86 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EDC3Q96F86 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EDC3Q96F86 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EDC3Q96F86 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EDC3Q96F86 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EDC3Q96F86 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
EDC3Q96F86 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EDC3Q96F86 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EDC3Q96F86 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EDC3Q96F86 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EDC3Q96F86 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EDC3Q96F86 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EDC3Q96F86 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EDC3Q96F86 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EDC3Q96F86 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EDC3Q96F86 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EDC3Q96F86 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EDC3Q96F86 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EDC3Q96F86 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EDC3Q96F86 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EDC3Q96F86 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EDC3Q96F86 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EDC3Q96F86 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EDC3Q96F86 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EDC3Q96F86 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EDC3Q96F86 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EDC3Q96F86 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EDC3Q96F86 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EDC3Q96F86 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EDC3Q96F86 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EDC3Q96F86 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EDC3Q96F86 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EDC3Q96F86 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
EDC3Q96F86 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
EDC3Q96F86 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EDC3Q96F86 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EDC3Q96F86 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EDC3Q96F86 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EDC3Q96F86 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
EDC3Q96F86 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
EDC3Q96F86 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
EDC3Q96F86 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EDC3Q96F86 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EDC3Q96F86 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EDC3Q96F86 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EDC3Q96F86 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms