Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ1

FAM3D, Protein FAM3D, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3DQ96BQ1 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM3DQ96BQ1 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM3DQ96BQ1 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM3DQ96BQ1 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM3DQ96BQ1 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM3DQ96BQ1 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM3DQ96BQ1 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM3DQ96BQ1 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM3DQ96BQ1 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM3DQ96BQ1 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM3DQ96BQ1 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM3DQ96BQ1 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM3DQ96BQ1 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM3DQ96BQ1 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM3DQ96BQ1 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM3DQ96BQ1 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM3DQ96BQ1 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM3DQ96BQ1 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM3DQ96BQ1 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM3DQ96BQ1 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM3DQ96BQ1 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM3DQ96BQ1 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM3DQ96BQ1 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM3DQ96BQ1 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM3DQ96BQ1 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM3DQ96BQ1 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM3DQ96BQ1 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM3DQ96BQ1 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM3DQ96BQ1 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM3DQ96BQ1 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM3DQ96BQ1 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM3DQ96BQ1 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM3DQ96BQ1 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM3DQ96BQ1 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM3DQ96BQ1 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM3DQ96BQ1 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM3DQ96BQ1 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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FAM3DQ96BQ1 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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FAM3DQ96BQ1 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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FAM3DQ96BQ1 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM3DQ96BQ1 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM3DQ96BQ1 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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FAM3DQ96BQ1 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM3DQ96BQ1 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM3DQ96BQ1 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM3DQ96BQ1 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM3DQ96BQ1 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM3DQ96BQ1 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM3DQ96BQ1 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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FAM3DQ96BQ1 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM3DQ96BQ1 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM3DQ96BQ1 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM3DQ96BQ1 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM3DQ96BQ1 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM3DQ96BQ1 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM3DQ96BQ1 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM3DQ96BQ1 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM3DQ96BQ1 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM3DQ96BQ1 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM3DQ96BQ1 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM3DQ96BQ1 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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