Protein–RNA interactions for Protein: Q969Q1

TRIM63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, humanhuman

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Length 353 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM63Q969Q1 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM63Q969Q1 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM63Q969Q1 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM63Q969Q1 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM63Q969Q1 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM63Q969Q1 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM63Q969Q1 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM63Q969Q1 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM63Q969Q1 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM63Q969Q1 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM63Q969Q1 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM63Q969Q1 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM63Q969Q1 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM63Q969Q1 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM63Q969Q1 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM63Q969Q1 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM63Q969Q1 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM63Q969Q1 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM63Q969Q1 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM63Q969Q1 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM63Q969Q1 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM63Q969Q1 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM63Q969Q1 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM63Q969Q1 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM63Q969Q1 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM63Q969Q1 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM63Q969Q1 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM63Q969Q1 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM63Q969Q1 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM63Q969Q1 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM63Q969Q1 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM63Q969Q1 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM63Q969Q1 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM63Q969Q1 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM63Q969Q1 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM63Q969Q1 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM63Q969Q1 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM63Q969Q1 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM63Q969Q1 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM63Q969Q1 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM63Q969Q1 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
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TRIM63Q969Q1 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM63Q969Q1 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM63Q969Q1 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM63Q969Q1 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM63Q969Q1 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM63Q969Q1 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM63Q969Q1 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM63Q969Q1 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM63Q969Q1 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM63Q969Q1 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM63Q969Q1 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM63Q969Q1 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM63Q969Q1 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM63Q969Q1 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
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TRIM63Q969Q1 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM63Q969Q1 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
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TRIM63Q969Q1 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
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TRIM63Q969Q1 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRIM63Q969Q1 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
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TRIM63Q969Q1 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRIM63Q969Q1 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRIM63Q969Q1 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRIM63Q969Q1 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRIM63Q969Q1 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM63Q969Q1 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM63Q969Q1 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM63Q969Q1 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM63Q969Q1 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM63Q969Q1 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM63Q969Q1 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM63Q969Q1 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM63Q969Q1 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM63Q969Q1 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM63Q969Q1 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM63Q969Q1 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM63Q969Q1 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM63Q969Q1 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM63Q969Q1 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM63Q969Q1 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM63Q969Q1 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM63Q969Q1 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM63Q969Q1 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM63Q969Q1 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM63Q969Q1 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM63Q969Q1 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM63Q969Q1 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
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