Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG08

HELB, DNA helicase B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELBQ8NG08 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HELBQ8NG08 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HELBQ8NG08 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HELBQ8NG08 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HELBQ8NG08 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HELBQ8NG08 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HELBQ8NG08 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HELBQ8NG08 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HELBQ8NG08 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HELBQ8NG08 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
HELBQ8NG08 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
HELBQ8NG08 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
HELBQ8NG08 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HELBQ8NG08 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HELBQ8NG08 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HELBQ8NG08 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HELBQ8NG08 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HELBQ8NG08 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HELBQ8NG08 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HELBQ8NG08 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HELBQ8NG08 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HELBQ8NG08 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HELBQ8NG08 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HELBQ8NG08 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HELBQ8NG08 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HELBQ8NG08 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HELBQ8NG08 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HELBQ8NG08 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HELBQ8NG08 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
HELBQ8NG08 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HELBQ8NG08 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HELBQ8NG08 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
HELBQ8NG08 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HELBQ8NG08 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HELBQ8NG08 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HELBQ8NG08 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HELBQ8NG08 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HELBQ8NG08 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HELBQ8NG08 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HELBQ8NG08 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HELBQ8NG08 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HELBQ8NG08 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HELBQ8NG08 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HELBQ8NG08 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HELBQ8NG08 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HELBQ8NG08 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
HELBQ8NG08 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HELBQ8NG08 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HELBQ8NG08 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HELBQ8NG08 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HELBQ8NG08 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HELBQ8NG08 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HELBQ8NG08 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HELBQ8NG08 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HELBQ8NG08 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
HELBQ8NG08 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
HELBQ8NG08 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
HELBQ8NG08 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
HELBQ8NG08 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
HELBQ8NG08 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
HELBQ8NG08 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HELBQ8NG08 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HELBQ8NG08 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HELBQ8NG08 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HELBQ8NG08 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HELBQ8NG08 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HELBQ8NG08 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HELBQ8NG08 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HELBQ8NG08 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
HELBQ8NG08 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HELBQ8NG08 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
HELBQ8NG08 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HELBQ8NG08 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HELBQ8NG08 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HELBQ8NG08 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HELBQ8NG08 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HELBQ8NG08 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HELBQ8NG08 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HELBQ8NG08 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HELBQ8NG08 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HELBQ8NG08 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HELBQ8NG08 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HELBQ8NG08 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HELBQ8NG08 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HELBQ8NG08 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HELBQ8NG08 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HELBQ8NG08 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HELBQ8NG08 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HELBQ8NG08 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HELBQ8NG08 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HELBQ8NG08 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HELBQ8NG08 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HELBQ8NG08 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HELBQ8NG08 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HELBQ8NG08 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
HELBQ8NG08 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HELBQ8NG08 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HELBQ8NG08 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HELBQ8NG08 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HELBQ8NG08 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms