Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW9

MYRIP, Rab effector MyRIP, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYRIPQ8NFW9 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MYRIPQ8NFW9 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
MYRIPQ8NFW9 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
MYRIPQ8NFW9 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC20■□□□□ 0.79
MYRIPQ8NFW9 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MYRIPQ8NFW9 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
MYRIPQ8NFW9 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
MYRIPQ8NFW9 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
MYRIPQ8NFW9 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
MYRIPQ8NFW9 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MYRIPQ8NFW9 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MYRIPQ8NFW9 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
MYRIPQ8NFW9 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
MYRIPQ8NFW9 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MYRIPQ8NFW9 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MYRIPQ8NFW9 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MYRIPQ8NFW9 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MYRIPQ8NFW9 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC20■□□□□ 0.79
MYRIPQ8NFW9 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MYRIPQ8NFW9 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
MYRIPQ8NFW9 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC20■□□□□ 0.79
MYRIPQ8NFW9 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
MYRIPQ8NFW9 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
MYRIPQ8NFW9 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MYRIPQ8NFW9 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MYRIPQ8NFW9 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MYRIPQ8NFW9 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MYRIPQ8NFW9 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MYRIPQ8NFW9 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MYRIPQ8NFW9 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MYRIPQ8NFW9 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MYRIPQ8NFW9 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MYRIPQ8NFW9 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MYRIPQ8NFW9 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MYRIPQ8NFW9 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MYRIPQ8NFW9 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MYRIPQ8NFW9 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MYRIPQ8NFW9 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MYRIPQ8NFW9 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MYRIPQ8NFW9 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MYRIPQ8NFW9 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MYRIPQ8NFW9 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MYRIPQ8NFW9 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MYRIPQ8NFW9 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MYRIPQ8NFW9 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MYRIPQ8NFW9 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MYRIPQ8NFW9 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MYRIPQ8NFW9 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MYRIPQ8NFW9 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MYRIPQ8NFW9 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MYRIPQ8NFW9 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MYRIPQ8NFW9 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MYRIPQ8NFW9 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MYRIPQ8NFW9 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MYRIPQ8NFW9 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MYRIPQ8NFW9 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MYRIPQ8NFW9 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MYRIPQ8NFW9 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MYRIPQ8NFW9 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MYRIPQ8NFW9 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MYRIPQ8NFW9 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MYRIPQ8NFW9 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MYRIPQ8NFW9 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MYRIPQ8NFW9 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MYRIPQ8NFW9 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MYRIPQ8NFW9 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MYRIPQ8NFW9 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MYRIPQ8NFW9 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MYRIPQ8NFW9 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MYRIPQ8NFW9 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MYRIPQ8NFW9 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MYRIPQ8NFW9 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MYRIPQ8NFW9 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MYRIPQ8NFW9 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MYRIPQ8NFW9 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MYRIPQ8NFW9 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MYRIPQ8NFW9 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MYRIPQ8NFW9 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MYRIPQ8NFW9 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MYRIPQ8NFW9 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MYRIPQ8NFW9 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MYRIPQ8NFW9 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MYRIPQ8NFW9 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MYRIPQ8NFW9 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MYRIPQ8NFW9 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
MYRIPQ8NFW9 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MYRIPQ8NFW9 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MYRIPQ8NFW9 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MYRIPQ8NFW9 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
MYRIPQ8NFW9 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
MYRIPQ8NFW9 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
MYRIPQ8NFW9 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
MYRIPQ8NFW9 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
MYRIPQ8NFW9 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
MYRIPQ8NFW9 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MYRIPQ8NFW9 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MYRIPQ8NFW9 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MYRIPQ8NFW9 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MYRIPQ8NFW9 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MYRIPQ8NFW9 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms