Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDP4

ZNF439, Zinc finger protein 439, humanhuman

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Length 499 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF439Q8NDP4 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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ZNF439Q8NDP4 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF439Q8NDP4 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF439Q8NDP4 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF439Q8NDP4 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF439Q8NDP4 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF439Q8NDP4 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF439Q8NDP4 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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ZNF439Q8NDP4 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF439Q8NDP4 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF439Q8NDP4 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF439Q8NDP4 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
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ZNF439Q8NDP4 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF439Q8NDP4 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
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ZNF439Q8NDP4 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF439Q8NDP4 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF439Q8NDP4 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF439Q8NDP4 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF439Q8NDP4 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF439Q8NDP4 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF439Q8NDP4 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF439Q8NDP4 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF439Q8NDP4 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF439Q8NDP4 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF439Q8NDP4 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF439Q8NDP4 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF439Q8NDP4 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF439Q8NDP4 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF439Q8NDP4 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF439Q8NDP4 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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ZNF439Q8NDP4 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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ZNF439Q8NDP4 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF439Q8NDP4 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF439Q8NDP4 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF439Q8NDP4 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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ZNF439Q8NDP4 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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ZNF439Q8NDP4 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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ZNF439Q8NDP4 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF439Q8NDP4 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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ZNF439Q8NDP4 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF439Q8NDP4 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF439Q8NDP4 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF439Q8NDP4 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF439Q8NDP4 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF439Q8NDP4 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF439Q8NDP4 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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