Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCL9

APCDD1L, Protein APCDD1-like, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APCDD1LQ8NCL9 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APCDD1LQ8NCL9 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APCDD1LQ8NCL9 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APCDD1LQ8NCL9 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APCDD1LQ8NCL9 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APCDD1LQ8NCL9 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APCDD1LQ8NCL9 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APCDD1LQ8NCL9 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APCDD1LQ8NCL9 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APCDD1LQ8NCL9 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APCDD1LQ8NCL9 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APCDD1LQ8NCL9 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APCDD1LQ8NCL9 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APCDD1LQ8NCL9 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
APCDD1LQ8NCL9 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APCDD1LQ8NCL9 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APCDD1LQ8NCL9 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APCDD1LQ8NCL9 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APCDD1LQ8NCL9 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APCDD1LQ8NCL9 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APCDD1LQ8NCL9 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APCDD1LQ8NCL9 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APCDD1LQ8NCL9 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APCDD1LQ8NCL9 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APCDD1LQ8NCL9 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
APCDD1LQ8NCL9 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
APCDD1LQ8NCL9 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
APCDD1LQ8NCL9 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
APCDD1LQ8NCL9 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
APCDD1LQ8NCL9 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
APCDD1LQ8NCL9 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
APCDD1LQ8NCL9 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
APCDD1LQ8NCL9 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
APCDD1LQ8NCL9 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
APCDD1LQ8NCL9 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
APCDD1LQ8NCL9 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
APCDD1LQ8NCL9 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
APCDD1LQ8NCL9 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
APCDD1LQ8NCL9 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
APCDD1LQ8NCL9 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
APCDD1LQ8NCL9 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
APCDD1LQ8NCL9 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
APCDD1LQ8NCL9 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
APCDD1LQ8NCL9 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
APCDD1LQ8NCL9 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
APCDD1LQ8NCL9 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
APCDD1LQ8NCL9 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
APCDD1LQ8NCL9 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
APCDD1LQ8NCL9 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
APCDD1LQ8NCL9 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
APCDD1LQ8NCL9 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
APCDD1LQ8NCL9 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
APCDD1LQ8NCL9 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
APCDD1LQ8NCL9 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
APCDD1LQ8NCL9 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
APCDD1LQ8NCL9 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
APCDD1LQ8NCL9 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
APCDD1LQ8NCL9 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
APCDD1LQ8NCL9 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
APCDD1LQ8NCL9 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
APCDD1LQ8NCL9 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
APCDD1LQ8NCL9 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
APCDD1LQ8NCL9 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
APCDD1LQ8NCL9 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
APCDD1LQ8NCL9 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
APCDD1LQ8NCL9 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
APCDD1LQ8NCL9 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
APCDD1LQ8NCL9 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
APCDD1LQ8NCL9 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
APCDD1LQ8NCL9 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
APCDD1LQ8NCL9 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
APCDD1LQ8NCL9 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
APCDD1LQ8NCL9 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
APCDD1LQ8NCL9 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
APCDD1LQ8NCL9 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
APCDD1LQ8NCL9 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
APCDD1LQ8NCL9 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
APCDD1LQ8NCL9 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
APCDD1LQ8NCL9 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
APCDD1LQ8NCL9 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
APCDD1LQ8NCL9 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
APCDD1LQ8NCL9 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
APCDD1LQ8NCL9 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
APCDD1LQ8NCL9 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
APCDD1LQ8NCL9 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
APCDD1LQ8NCL9 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
APCDD1LQ8NCL9 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
APCDD1LQ8NCL9 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
APCDD1LQ8NCL9 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
APCDD1LQ8NCL9 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
APCDD1LQ8NCL9 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
APCDD1LQ8NCL9 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
APCDD1LQ8NCL9 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
APCDD1LQ8NCL9 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
APCDD1LQ8NCL9 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
APCDD1LQ8NCL9 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
APCDD1LQ8NCL9 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
APCDD1LQ8NCL9 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
APCDD1LQ8NCL9 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
APCDD1LQ8NCL9 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms