Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCD3

HJURP, Holliday junction recognition protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURPQ8NCD3 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HJURPQ8NCD3 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HJURPQ8NCD3 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HJURPQ8NCD3 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HJURPQ8NCD3 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HJURPQ8NCD3 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HJURPQ8NCD3 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HJURPQ8NCD3 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
HJURPQ8NCD3 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
HJURPQ8NCD3 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HJURPQ8NCD3 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HJURPQ8NCD3 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HJURPQ8NCD3 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HJURPQ8NCD3 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HJURPQ8NCD3 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HJURPQ8NCD3 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HJURPQ8NCD3 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HJURPQ8NCD3 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HJURPQ8NCD3 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HJURPQ8NCD3 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HJURPQ8NCD3 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HJURPQ8NCD3 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
HJURPQ8NCD3 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HJURPQ8NCD3 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HJURPQ8NCD3 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HJURPQ8NCD3 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HJURPQ8NCD3 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HJURPQ8NCD3 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HJURPQ8NCD3 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HJURPQ8NCD3 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HJURPQ8NCD3 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HJURPQ8NCD3 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HJURPQ8NCD3 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HJURPQ8NCD3 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC19■□□□□ 0.63
HJURPQ8NCD3 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HJURPQ8NCD3 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HJURPQ8NCD3 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
HJURPQ8NCD3 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HJURPQ8NCD3 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HJURPQ8NCD3 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HJURPQ8NCD3 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HJURPQ8NCD3 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HJURPQ8NCD3 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HJURPQ8NCD3 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HJURPQ8NCD3 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC19■□□□□ 0.63
HJURPQ8NCD3 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HJURPQ8NCD3 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HJURPQ8NCD3 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HJURPQ8NCD3 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HJURPQ8NCD3 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HJURPQ8NCD3 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HJURPQ8NCD3 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HJURPQ8NCD3 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HJURPQ8NCD3 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HJURPQ8NCD3 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HJURPQ8NCD3 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HJURPQ8NCD3 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HJURPQ8NCD3 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HJURPQ8NCD3 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HJURPQ8NCD3 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HJURPQ8NCD3 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HJURPQ8NCD3 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HJURPQ8NCD3 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HJURPQ8NCD3 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HJURPQ8NCD3 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HJURPQ8NCD3 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HJURPQ8NCD3 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HJURPQ8NCD3 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HJURPQ8NCD3 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HJURPQ8NCD3 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HJURPQ8NCD3 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HJURPQ8NCD3 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HJURPQ8NCD3 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HJURPQ8NCD3 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HJURPQ8NCD3 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HJURPQ8NCD3 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HJURPQ8NCD3 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HJURPQ8NCD3 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HJURPQ8NCD3 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HJURPQ8NCD3 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HJURPQ8NCD3 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HJURPQ8NCD3 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HJURPQ8NCD3 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HJURPQ8NCD3 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HJURPQ8NCD3 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HJURPQ8NCD3 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HJURPQ8NCD3 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HJURPQ8NCD3 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HJURPQ8NCD3 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HJURPQ8NCD3 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HJURPQ8NCD3 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HJURPQ8NCD3 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
HJURPQ8NCD3 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HJURPQ8NCD3 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HJURPQ8NCD3 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HJURPQ8NCD3 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HJURPQ8NCD3 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HJURPQ8NCD3 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HJURPQ8NCD3 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HJURPQ8NCD3 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms