Protein–RNA interactions for Protein: Q8N474

SFRP1, Secreted frizzled-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP1Q8N474 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SFRP1Q8N474 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SFRP1Q8N474 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SFRP1Q8N474 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SFRP1Q8N474 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SFRP1Q8N474 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SFRP1Q8N474 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SFRP1Q8N474 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SFRP1Q8N474 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SFRP1Q8N474 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SFRP1Q8N474 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SFRP1Q8N474 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SFRP1Q8N474 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SFRP1Q8N474 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SFRP1Q8N474 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SFRP1Q8N474 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFRP1Q8N474 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFRP1Q8N474 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFRP1Q8N474 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFRP1Q8N474 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFRP1Q8N474 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFRP1Q8N474 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFRP1Q8N474 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFRP1Q8N474 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFRP1Q8N474 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFRP1Q8N474 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFRP1Q8N474 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFRP1Q8N474 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SFRP1Q8N474 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFRP1Q8N474 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFRP1Q8N474 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFRP1Q8N474 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFRP1Q8N474 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SFRP1Q8N474 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFRP1Q8N474 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFRP1Q8N474 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFRP1Q8N474 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFRP1Q8N474 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFRP1Q8N474 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFRP1Q8N474 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFRP1Q8N474 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFRP1Q8N474 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFRP1Q8N474 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFRP1Q8N474 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFRP1Q8N474 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFRP1Q8N474 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFRP1Q8N474 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFRP1Q8N474 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SFRP1Q8N474 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFRP1Q8N474 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFRP1Q8N474 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFRP1Q8N474 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFRP1Q8N474 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFRP1Q8N474 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFRP1Q8N474 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFRP1Q8N474 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFRP1Q8N474 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SFRP1Q8N474 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFRP1Q8N474 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFRP1Q8N474 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFRP1Q8N474 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFRP1Q8N474 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFRP1Q8N474 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFRP1Q8N474 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFRP1Q8N474 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFRP1Q8N474 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFRP1Q8N474 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SFRP1Q8N474 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFRP1Q8N474 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SFRP1Q8N474 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFRP1Q8N474 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFRP1Q8N474 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFRP1Q8N474 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFRP1Q8N474 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFRP1Q8N474 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFRP1Q8N474 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFRP1Q8N474 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFRP1Q8N474 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFRP1Q8N474 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFRP1Q8N474 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFRP1Q8N474 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SFRP1Q8N474 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SFRP1Q8N474 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SFRP1Q8N474 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SFRP1Q8N474 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SFRP1Q8N474 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SFRP1Q8N474 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SFRP1Q8N474 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SFRP1Q8N474 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SFRP1Q8N474 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SFRP1Q8N474 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SFRP1Q8N474 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SFRP1Q8N474 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SFRP1Q8N474 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SFRP1Q8N474 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SFRP1Q8N474 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SFRP1Q8N474 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SFRP1Q8N474 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SFRP1Q8N474 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SFRP1Q8N474 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms