Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZA3

H1FOO, Histone H1oo, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H1FOOQ8IZA3 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H1FOOQ8IZA3 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H1FOOQ8IZA3 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H1FOOQ8IZA3 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H1FOOQ8IZA3 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H1FOOQ8IZA3 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H1FOOQ8IZA3 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H1FOOQ8IZA3 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H1FOOQ8IZA3 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H1FOOQ8IZA3 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H1FOOQ8IZA3 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H1FOOQ8IZA3 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H1FOOQ8IZA3 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H1FOOQ8IZA3 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
H1FOOQ8IZA3 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H1FOOQ8IZA3 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
H1FOOQ8IZA3 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H1FOOQ8IZA3 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H1FOOQ8IZA3 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H1FOOQ8IZA3 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H1FOOQ8IZA3 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H1FOOQ8IZA3 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H1FOOQ8IZA3 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H1FOOQ8IZA3 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H1FOOQ8IZA3 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H1FOOQ8IZA3 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H1FOOQ8IZA3 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H1FOOQ8IZA3 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H1FOOQ8IZA3 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
H1FOOQ8IZA3 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H1FOOQ8IZA3 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H1FOOQ8IZA3 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H1FOOQ8IZA3 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H1FOOQ8IZA3 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
H1FOOQ8IZA3 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H1FOOQ8IZA3 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H1FOOQ8IZA3 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H1FOOQ8IZA3 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H1FOOQ8IZA3 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H1FOOQ8IZA3 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H1FOOQ8IZA3 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H1FOOQ8IZA3 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H1FOOQ8IZA3 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H1FOOQ8IZA3 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H1FOOQ8IZA3 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H1FOOQ8IZA3 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H1FOOQ8IZA3 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H1FOOQ8IZA3 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
H1FOOQ8IZA3 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
H1FOOQ8IZA3 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H1FOOQ8IZA3 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H1FOOQ8IZA3 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H1FOOQ8IZA3 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H1FOOQ8IZA3 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H1FOOQ8IZA3 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H1FOOQ8IZA3 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H1FOOQ8IZA3 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H1FOOQ8IZA3 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H1FOOQ8IZA3 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H1FOOQ8IZA3 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H1FOOQ8IZA3 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
H1FOOQ8IZA3 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H1FOOQ8IZA3 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H1FOOQ8IZA3 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H1FOOQ8IZA3 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H1FOOQ8IZA3 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H1FOOQ8IZA3 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H1FOOQ8IZA3 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H1FOOQ8IZA3 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H1FOOQ8IZA3 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H1FOOQ8IZA3 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H1FOOQ8IZA3 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H1FOOQ8IZA3 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H1FOOQ8IZA3 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H1FOOQ8IZA3 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H1FOOQ8IZA3 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H1FOOQ8IZA3 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H1FOOQ8IZA3 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H1FOOQ8IZA3 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
H1FOOQ8IZA3 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H1FOOQ8IZA3 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
H1FOOQ8IZA3 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H1FOOQ8IZA3 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H1FOOQ8IZA3 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H1FOOQ8IZA3 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H1FOOQ8IZA3 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
H1FOOQ8IZA3 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H1FOOQ8IZA3 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H1FOOQ8IZA3 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H1FOOQ8IZA3 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H1FOOQ8IZA3 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H1FOOQ8IZA3 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H1FOOQ8IZA3 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H1FOOQ8IZA3 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H1FOOQ8IZA3 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H1FOOQ8IZA3 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H1FOOQ8IZA3 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H1FOOQ8IZA3 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H1FOOQ8IZA3 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H1FOOQ8IZA3 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms