Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWD4

CCDC117, Coiled-coil domain-containing protein 117, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC117Q8IWD4 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC117Q8IWD4 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC117Q8IWD4 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC117Q8IWD4 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC117Q8IWD4 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC117Q8IWD4 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC117Q8IWD4 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC117Q8IWD4 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC117Q8IWD4 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC117Q8IWD4 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC117Q8IWD4 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC117Q8IWD4 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC117Q8IWD4 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC117Q8IWD4 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC117Q8IWD4 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC117Q8IWD4 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC117Q8IWD4 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC117Q8IWD4 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC117Q8IWD4 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC117Q8IWD4 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC117Q8IWD4 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC117Q8IWD4 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC117Q8IWD4 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC117Q8IWD4 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC117Q8IWD4 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC117Q8IWD4 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC117Q8IWD4 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC117Q8IWD4 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC117Q8IWD4 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC117Q8IWD4 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC117Q8IWD4 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC117Q8IWD4 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC117Q8IWD4 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC117Q8IWD4 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC117Q8IWD4 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC117Q8IWD4 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC117Q8IWD4 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC117Q8IWD4 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC117Q8IWD4 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC117Q8IWD4 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC117Q8IWD4 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC117Q8IWD4 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC117Q8IWD4 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC117Q8IWD4 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC117Q8IWD4 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC117Q8IWD4 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC117Q8IWD4 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC117Q8IWD4 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC117Q8IWD4 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC117Q8IWD4 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC117Q8IWD4 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC117Q8IWD4 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC117Q8IWD4 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC117Q8IWD4 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC117Q8IWD4 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC117Q8IWD4 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC117Q8IWD4 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC117Q8IWD4 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC117Q8IWD4 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC117Q8IWD4 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC117Q8IWD4 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC117Q8IWD4 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC117Q8IWD4 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC117Q8IWD4 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC117Q8IWD4 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC117Q8IWD4 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC117Q8IWD4 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC117Q8IWD4 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC117Q8IWD4 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC117Q8IWD4 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC117Q8IWD4 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC117Q8IWD4 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC117Q8IWD4 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC117Q8IWD4 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC117Q8IWD4 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC117Q8IWD4 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC117Q8IWD4 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC117Q8IWD4 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC117Q8IWD4 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC117Q8IWD4 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC117Q8IWD4 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC117Q8IWD4 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC117Q8IWD4 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC117Q8IWD4 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC117Q8IWD4 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC117Q8IWD4 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC117Q8IWD4 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC117Q8IWD4 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC117Q8IWD4 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC117Q8IWD4 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC117Q8IWD4 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC117Q8IWD4 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC117Q8IWD4 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC117Q8IWD4 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC117Q8IWD4 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC117Q8IWD4 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC117Q8IWD4 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC117Q8IWD4 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC117Q8IWD4 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC117Q8IWD4 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms