Protein–RNA interactions for Protein: Q8IW40

CCDC103, Coiled-coil domain-containing protein 103, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC103Q8IW40 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC103Q8IW40 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC103Q8IW40 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC103Q8IW40 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC103Q8IW40 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC103Q8IW40 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC103Q8IW40 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC103Q8IW40 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC103Q8IW40 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC103Q8IW40 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC103Q8IW40 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC103Q8IW40 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC103Q8IW40 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC103Q8IW40 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC103Q8IW40 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC103Q8IW40 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC103Q8IW40 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC103Q8IW40 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC103Q8IW40 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC103Q8IW40 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC103Q8IW40 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC103Q8IW40 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC103Q8IW40 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC103Q8IW40 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC103Q8IW40 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC103Q8IW40 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC103Q8IW40 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC103Q8IW40 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC103Q8IW40 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC103Q8IW40 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC103Q8IW40 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC103Q8IW40 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC103Q8IW40 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC103Q8IW40 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC103Q8IW40 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC103Q8IW40 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC103Q8IW40 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC103Q8IW40 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC103Q8IW40 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC103Q8IW40 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC103Q8IW40 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC103Q8IW40 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC103Q8IW40 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC103Q8IW40 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC103Q8IW40 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC103Q8IW40 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC103Q8IW40 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC103Q8IW40 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC103Q8IW40 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC103Q8IW40 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC103Q8IW40 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC103Q8IW40 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC103Q8IW40 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC103Q8IW40 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC103Q8IW40 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC103Q8IW40 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC103Q8IW40 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC103Q8IW40 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC103Q8IW40 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC103Q8IW40 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC103Q8IW40 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC103Q8IW40 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC103Q8IW40 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC103Q8IW40 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC103Q8IW40 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC103Q8IW40 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC103Q8IW40 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC103Q8IW40 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC103Q8IW40 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC103Q8IW40 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC103Q8IW40 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC103Q8IW40 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC103Q8IW40 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC103Q8IW40 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC103Q8IW40 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC103Q8IW40 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC103Q8IW40 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC103Q8IW40 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC103Q8IW40 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC103Q8IW40 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC103Q8IW40 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC103Q8IW40 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC103Q8IW40 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC103Q8IW40 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC103Q8IW40 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC103Q8IW40 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC103Q8IW40 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC103Q8IW40 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC103Q8IW40 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC103Q8IW40 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC103Q8IW40 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC103Q8IW40 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC103Q8IW40 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC103Q8IW40 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC103Q8IW40 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC103Q8IW40 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC103Q8IW40 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC103Q8IW40 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC103Q8IW40 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC103Q8IW40 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms