Protein–RNA interactions for Protein: Q86WV1

SKAP1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP1Q86WV1 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SKAP1Q86WV1 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SKAP1Q86WV1 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SKAP1Q86WV1 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SKAP1Q86WV1 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SKAP1Q86WV1 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SKAP1Q86WV1 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SKAP1Q86WV1 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SKAP1Q86WV1 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SKAP1Q86WV1 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SKAP1Q86WV1 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SKAP1Q86WV1 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SKAP1Q86WV1 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SKAP1Q86WV1 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SKAP1Q86WV1 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SKAP1Q86WV1 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SKAP1Q86WV1 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SKAP1Q86WV1 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SKAP1Q86WV1 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SKAP1Q86WV1 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SKAP1Q86WV1 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SKAP1Q86WV1 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SKAP1Q86WV1 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SKAP1Q86WV1 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SKAP1Q86WV1 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SKAP1Q86WV1 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SKAP1Q86WV1 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SKAP1Q86WV1 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SKAP1Q86WV1 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SKAP1Q86WV1 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SKAP1Q86WV1 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SKAP1Q86WV1 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SKAP1Q86WV1 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SKAP1Q86WV1 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SKAP1Q86WV1 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SKAP1Q86WV1 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SKAP1Q86WV1 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SKAP1Q86WV1 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SKAP1Q86WV1 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SKAP1Q86WV1 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SKAP1Q86WV1 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SKAP1Q86WV1 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SKAP1Q86WV1 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SKAP1Q86WV1 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SKAP1Q86WV1 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SKAP1Q86WV1 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SKAP1Q86WV1 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SKAP1Q86WV1 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SKAP1Q86WV1 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SKAP1Q86WV1 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SKAP1Q86WV1 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SKAP1Q86WV1 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SKAP1Q86WV1 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SKAP1Q86WV1 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SKAP1Q86WV1 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SKAP1Q86WV1 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SKAP1Q86WV1 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SKAP1Q86WV1 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SKAP1Q86WV1 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SKAP1Q86WV1 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SKAP1Q86WV1 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SKAP1Q86WV1 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SKAP1Q86WV1 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SKAP1Q86WV1 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SKAP1Q86WV1 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SKAP1Q86WV1 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SKAP1Q86WV1 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SKAP1Q86WV1 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SKAP1Q86WV1 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SKAP1Q86WV1 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SKAP1Q86WV1 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SKAP1Q86WV1 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SKAP1Q86WV1 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SKAP1Q86WV1 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SKAP1Q86WV1 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SKAP1Q86WV1 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SKAP1Q86WV1 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SKAP1Q86WV1 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SKAP1Q86WV1 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SKAP1Q86WV1 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SKAP1Q86WV1 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SKAP1Q86WV1 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SKAP1Q86WV1 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SKAP1Q86WV1 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SKAP1Q86WV1 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SKAP1Q86WV1 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SKAP1Q86WV1 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SKAP1Q86WV1 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SKAP1Q86WV1 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SKAP1Q86WV1 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SKAP1Q86WV1 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SKAP1Q86WV1 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SKAP1Q86WV1 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SKAP1Q86WV1 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SKAP1Q86WV1 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SKAP1Q86WV1 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SKAP1Q86WV1 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SKAP1Q86WV1 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SKAP1Q86WV1 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SKAP1Q86WV1 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms