Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z614

SNX20, Sorting nexin-20, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX20Q7Z614 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX20Q7Z614 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX20Q7Z614 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX20Q7Z614 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX20Q7Z614 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX20Q7Z614 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX20Q7Z614 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX20Q7Z614 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX20Q7Z614 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX20Q7Z614 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX20Q7Z614 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX20Q7Z614 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX20Q7Z614 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX20Q7Z614 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX20Q7Z614 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX20Q7Z614 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX20Q7Z614 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX20Q7Z614 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX20Q7Z614 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX20Q7Z614 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX20Q7Z614 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX20Q7Z614 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX20Q7Z614 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX20Q7Z614 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX20Q7Z614 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX20Q7Z614 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX20Q7Z614 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX20Q7Z614 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX20Q7Z614 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX20Q7Z614 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX20Q7Z614 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX20Q7Z614 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX20Q7Z614 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX20Q7Z614 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX20Q7Z614 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX20Q7Z614 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX20Q7Z614 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX20Q7Z614 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX20Q7Z614 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX20Q7Z614 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX20Q7Z614 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX20Q7Z614 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX20Q7Z614 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX20Q7Z614 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX20Q7Z614 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX20Q7Z614 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX20Q7Z614 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX20Q7Z614 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX20Q7Z614 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX20Q7Z614 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX20Q7Z614 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX20Q7Z614 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX20Q7Z614 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX20Q7Z614 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX20Q7Z614 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX20Q7Z614 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX20Q7Z614 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX20Q7Z614 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX20Q7Z614 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX20Q7Z614 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX20Q7Z614 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX20Q7Z614 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX20Q7Z614 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX20Q7Z614 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX20Q7Z614 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX20Q7Z614 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX20Q7Z614 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX20Q7Z614 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX20Q7Z614 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX20Q7Z614 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX20Q7Z614 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX20Q7Z614 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX20Q7Z614 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX20Q7Z614 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX20Q7Z614 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX20Q7Z614 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX20Q7Z614 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX20Q7Z614 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX20Q7Z614 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX20Q7Z614 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX20Q7Z614 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX20Q7Z614 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX20Q7Z614 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX20Q7Z614 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX20Q7Z614 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX20Q7Z614 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX20Q7Z614 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX20Q7Z614 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX20Q7Z614 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX20Q7Z614 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX20Q7Z614 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX20Q7Z614 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX20Q7Z614 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX20Q7Z614 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX20Q7Z614 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX20Q7Z614 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX20Q7Z614 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX20Q7Z614 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX20Q7Z614 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX20Q7Z614 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms