Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
USP43Q70EL4 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
USP43Q70EL4 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
USP43Q70EL4 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
USP43Q70EL4 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
USP43Q70EL4 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
USP43Q70EL4 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
USP43Q70EL4 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
USP43Q70EL4 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
USP43Q70EL4 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
USP43Q70EL4 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
USP43Q70EL4 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
USP43Q70EL4 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
USP43Q70EL4 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
USP43Q70EL4 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
USP43Q70EL4 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
USP43Q70EL4 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
USP43Q70EL4 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
USP43Q70EL4 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
USP43Q70EL4 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
USP43Q70EL4 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
USP43Q70EL4 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
USP43Q70EL4 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
USP43Q70EL4 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP43Q70EL4 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP43Q70EL4 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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