Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW61

BBS12, Bardet-Biedl syndrome 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS12Q6ZW61 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BBS12Q6ZW61 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BBS12Q6ZW61 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BBS12Q6ZW61 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BBS12Q6ZW61 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BBS12Q6ZW61 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BBS12Q6ZW61 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
BBS12Q6ZW61 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
BBS12Q6ZW61 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BBS12Q6ZW61 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BBS12Q6ZW61 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BBS12Q6ZW61 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BBS12Q6ZW61 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BBS12Q6ZW61 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BBS12Q6ZW61 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BBS12Q6ZW61 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BBS12Q6ZW61 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BBS12Q6ZW61 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BBS12Q6ZW61 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BBS12Q6ZW61 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
BBS12Q6ZW61 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BBS12Q6ZW61 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BBS12Q6ZW61 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BBS12Q6ZW61 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BBS12Q6ZW61 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BBS12Q6ZW61 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BBS12Q6ZW61 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BBS12Q6ZW61 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BBS12Q6ZW61 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BBS12Q6ZW61 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BBS12Q6ZW61 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BBS12Q6ZW61 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BBS12Q6ZW61 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BBS12Q6ZW61 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BBS12Q6ZW61 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BBS12Q6ZW61 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BBS12Q6ZW61 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BBS12Q6ZW61 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BBS12Q6ZW61 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BBS12Q6ZW61 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BBS12Q6ZW61 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BBS12Q6ZW61 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BBS12Q6ZW61 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BBS12Q6ZW61 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BBS12Q6ZW61 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BBS12Q6ZW61 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BBS12Q6ZW61 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BBS12Q6ZW61 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BBS12Q6ZW61 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BBS12Q6ZW61 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BBS12Q6ZW61 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BBS12Q6ZW61 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BBS12Q6ZW61 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BBS12Q6ZW61 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BBS12Q6ZW61 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BBS12Q6ZW61 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BBS12Q6ZW61 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BBS12Q6ZW61 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BBS12Q6ZW61 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BBS12Q6ZW61 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BBS12Q6ZW61 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BBS12Q6ZW61 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BBS12Q6ZW61 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BBS12Q6ZW61 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BBS12Q6ZW61 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BBS12Q6ZW61 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BBS12Q6ZW61 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BBS12Q6ZW61 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
BBS12Q6ZW61 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BBS12Q6ZW61 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BBS12Q6ZW61 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BBS12Q6ZW61 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BBS12Q6ZW61 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
BBS12Q6ZW61 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
BBS12Q6ZW61 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
BBS12Q6ZW61 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
BBS12Q6ZW61 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
BBS12Q6ZW61 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
BBS12Q6ZW61 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
BBS12Q6ZW61 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BBS12Q6ZW61 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BBS12Q6ZW61 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BBS12Q6ZW61 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BBS12Q6ZW61 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BBS12Q6ZW61 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
BBS12Q6ZW61 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BBS12Q6ZW61 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
BBS12Q6ZW61 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BBS12Q6ZW61 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BBS12Q6ZW61 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BBS12Q6ZW61 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BBS12Q6ZW61 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BBS12Q6ZW61 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BBS12Q6ZW61 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BBS12Q6ZW61 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BBS12Q6ZW61 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BBS12Q6ZW61 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BBS12Q6ZW61 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BBS12Q6ZW61 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BBS12Q6ZW61 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms