Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZP82

CCDC141, Coiled-coil domain-containing protein 141, humanhuman

Predictions only

Length 1,450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC141Q6ZP82 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC141Q6ZP82 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC141Q6ZP82 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC141Q6ZP82 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC141Q6ZP82 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC141Q6ZP82 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC141Q6ZP82 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC141Q6ZP82 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC141Q6ZP82 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC141Q6ZP82 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC141Q6ZP82 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC141Q6ZP82 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC141Q6ZP82 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC141Q6ZP82 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC141Q6ZP82 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC141Q6ZP82 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC141Q6ZP82 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC141Q6ZP82 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC141Q6ZP82 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC141Q6ZP82 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC141Q6ZP82 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC141Q6ZP82 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC141Q6ZP82 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC141Q6ZP82 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC141Q6ZP82 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC141Q6ZP82 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC141Q6ZP82 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC141Q6ZP82 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC141Q6ZP82 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC141Q6ZP82 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC141Q6ZP82 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC141Q6ZP82 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC141Q6ZP82 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC141Q6ZP82 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC141Q6ZP82 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC141Q6ZP82 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC141Q6ZP82 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC141Q6ZP82 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC141Q6ZP82 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC141Q6ZP82 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC141Q6ZP82 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC141Q6ZP82 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC141Q6ZP82 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC141Q6ZP82 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC141Q6ZP82 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC141Q6ZP82 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC141Q6ZP82 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC141Q6ZP82 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC141Q6ZP82 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC141Q6ZP82 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC141Q6ZP82 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC141Q6ZP82 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC141Q6ZP82 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC141Q6ZP82 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC141Q6ZP82 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC141Q6ZP82 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC141Q6ZP82 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC141Q6ZP82 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC141Q6ZP82 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC141Q6ZP82 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC141Q6ZP82 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC141Q6ZP82 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC141Q6ZP82 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC141Q6ZP82 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC141Q6ZP82 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC141Q6ZP82 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC141Q6ZP82 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC141Q6ZP82 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC141Q6ZP82 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC141Q6ZP82 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC141Q6ZP82 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC141Q6ZP82 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC141Q6ZP82 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC141Q6ZP82 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC141Q6ZP82 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CCDC141Q6ZP82 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CCDC141Q6ZP82 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
CCDC141Q6ZP82 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC141Q6ZP82 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC141Q6ZP82 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC141Q6ZP82 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC141Q6ZP82 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC141Q6ZP82 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC141Q6ZP82 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC141Q6ZP82 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC141Q6ZP82 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC141Q6ZP82 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC141Q6ZP82 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC141Q6ZP82 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC141Q6ZP82 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC141Q6ZP82 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC141Q6ZP82 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC141Q6ZP82 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC141Q6ZP82 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC141Q6ZP82 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC141Q6ZP82 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC141Q6ZP82 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC141Q6ZP82 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC141Q6ZP82 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC141Q6ZP82 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms