Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWE0

LRSAM1, E3 ubiquitin-protein ligase LRSAM1, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRSAM1Q6UWE0 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LRSAM1Q6UWE0 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LRSAM1Q6UWE0 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LRSAM1Q6UWE0 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LRSAM1Q6UWE0 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LRSAM1Q6UWE0 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LRSAM1Q6UWE0 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LRSAM1Q6UWE0 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LRSAM1Q6UWE0 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
LRSAM1Q6UWE0 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LRSAM1Q6UWE0 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LRSAM1Q6UWE0 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LRSAM1Q6UWE0 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LRSAM1Q6UWE0 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LRSAM1Q6UWE0 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRSAM1Q6UWE0 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
LRSAM1Q6UWE0 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRSAM1Q6UWE0 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRSAM1Q6UWE0 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRSAM1Q6UWE0 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRSAM1Q6UWE0 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRSAM1Q6UWE0 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRSAM1Q6UWE0 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRSAM1Q6UWE0 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRSAM1Q6UWE0 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRSAM1Q6UWE0 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
LRSAM1Q6UWE0 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRSAM1Q6UWE0 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRSAM1Q6UWE0 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRSAM1Q6UWE0 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRSAM1Q6UWE0 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRSAM1Q6UWE0 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRSAM1Q6UWE0 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRSAM1Q6UWE0 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRSAM1Q6UWE0 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRSAM1Q6UWE0 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRSAM1Q6UWE0 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRSAM1Q6UWE0 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRSAM1Q6UWE0 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRSAM1Q6UWE0 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRSAM1Q6UWE0 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRSAM1Q6UWE0 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRSAM1Q6UWE0 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRSAM1Q6UWE0 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRSAM1Q6UWE0 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRSAM1Q6UWE0 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRSAM1Q6UWE0 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRSAM1Q6UWE0 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRSAM1Q6UWE0 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRSAM1Q6UWE0 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRSAM1Q6UWE0 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRSAM1Q6UWE0 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRSAM1Q6UWE0 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRSAM1Q6UWE0 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRSAM1Q6UWE0 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
LRSAM1Q6UWE0 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRSAM1Q6UWE0 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRSAM1Q6UWE0 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRSAM1Q6UWE0 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRSAM1Q6UWE0 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRSAM1Q6UWE0 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRSAM1Q6UWE0 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRSAM1Q6UWE0 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRSAM1Q6UWE0 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRSAM1Q6UWE0 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRSAM1Q6UWE0 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRSAM1Q6UWE0 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRSAM1Q6UWE0 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
LRSAM1Q6UWE0 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRSAM1Q6UWE0 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRSAM1Q6UWE0 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRSAM1Q6UWE0 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRSAM1Q6UWE0 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRSAM1Q6UWE0 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRSAM1Q6UWE0 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRSAM1Q6UWE0 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRSAM1Q6UWE0 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRSAM1Q6UWE0 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRSAM1Q6UWE0 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRSAM1Q6UWE0 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRSAM1Q6UWE0 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRSAM1Q6UWE0 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRSAM1Q6UWE0 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRSAM1Q6UWE0 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRSAM1Q6UWE0 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRSAM1Q6UWE0 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LRSAM1Q6UWE0 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LRSAM1Q6UWE0 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LRSAM1Q6UWE0 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LRSAM1Q6UWE0 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LRSAM1Q6UWE0 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LRSAM1Q6UWE0 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LRSAM1Q6UWE0 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LRSAM1Q6UWE0 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LRSAM1Q6UWE0 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
LRSAM1Q6UWE0 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LRSAM1Q6UWE0 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LRSAM1Q6UWE0 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LRSAM1Q6UWE0 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LRSAM1Q6UWE0 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms