Protein–RNA interactions for Protein: Q6TFL3

CCDC171, Coiled-coil domain-containing protein 171, humanhuman

Predictions only

Length 1,326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC171Q6TFL3 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC171Q6TFL3 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC171Q6TFL3 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC171Q6TFL3 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC171Q6TFL3 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC171Q6TFL3 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC171Q6TFL3 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC171Q6TFL3 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC171Q6TFL3 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC171Q6TFL3 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC171Q6TFL3 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC171Q6TFL3 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC171Q6TFL3 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC171Q6TFL3 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC171Q6TFL3 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC171Q6TFL3 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC171Q6TFL3 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC171Q6TFL3 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC171Q6TFL3 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC171Q6TFL3 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC171Q6TFL3 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC171Q6TFL3 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC171Q6TFL3 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC171Q6TFL3 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC171Q6TFL3 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC171Q6TFL3 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC171Q6TFL3 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC171Q6TFL3 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC171Q6TFL3 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC171Q6TFL3 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC171Q6TFL3 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC171Q6TFL3 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC171Q6TFL3 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC171Q6TFL3 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC171Q6TFL3 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC171Q6TFL3 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC171Q6TFL3 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC171Q6TFL3 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC171Q6TFL3 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC171Q6TFL3 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC171Q6TFL3 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC171Q6TFL3 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC171Q6TFL3 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC171Q6TFL3 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC171Q6TFL3 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC171Q6TFL3 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC171Q6TFL3 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC171Q6TFL3 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC171Q6TFL3 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC171Q6TFL3 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC171Q6TFL3 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC171Q6TFL3 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC171Q6TFL3 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC171Q6TFL3 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC171Q6TFL3 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC171Q6TFL3 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC171Q6TFL3 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC171Q6TFL3 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC171Q6TFL3 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC171Q6TFL3 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC171Q6TFL3 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC171Q6TFL3 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC171Q6TFL3 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC171Q6TFL3 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC171Q6TFL3 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC171Q6TFL3 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC171Q6TFL3 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC171Q6TFL3 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC171Q6TFL3 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC171Q6TFL3 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC171Q6TFL3 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC171Q6TFL3 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC171Q6TFL3 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC171Q6TFL3 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC171Q6TFL3 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC171Q6TFL3 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC171Q6TFL3 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC171Q6TFL3 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC171Q6TFL3 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC171Q6TFL3 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC171Q6TFL3 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC171Q6TFL3 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC171Q6TFL3 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC171Q6TFL3 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC171Q6TFL3 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC171Q6TFL3 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC171Q6TFL3 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC171Q6TFL3 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC171Q6TFL3 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC171Q6TFL3 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC171Q6TFL3 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC171Q6TFL3 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC171Q6TFL3 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC171Q6TFL3 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC171Q6TFL3 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC171Q6TFL3 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC171Q6TFL3 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC171Q6TFL3 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC171Q6TFL3 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC171Q6TFL3 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms