Protein–RNA interactions for Protein: Q6PF15

KLHL35, Kelch-like protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL35Q6PF15 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms