Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUI1

CCDC144NL, Putative coiled-coil domain-containing protein 144 N-terminal-like, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC144NLQ6NUI1 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CCDC144NLQ6NUI1 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC144NLQ6NUI1 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CCDC144NLQ6NUI1 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CCDC144NLQ6NUI1 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC144NLQ6NUI1 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC144NLQ6NUI1 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC144NLQ6NUI1 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC144NLQ6NUI1 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC144NLQ6NUI1 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC144NLQ6NUI1 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CCDC144NLQ6NUI1 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC144NLQ6NUI1 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC144NLQ6NUI1 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC144NLQ6NUI1 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC144NLQ6NUI1 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC144NLQ6NUI1 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC144NLQ6NUI1 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CCDC144NLQ6NUI1 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC144NLQ6NUI1 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC144NLQ6NUI1 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC144NLQ6NUI1 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC144NLQ6NUI1 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC144NLQ6NUI1 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC144NLQ6NUI1 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC144NLQ6NUI1 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC144NLQ6NUI1 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC144NLQ6NUI1 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC144NLQ6NUI1 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC144NLQ6NUI1 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC144NLQ6NUI1 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC144NLQ6NUI1 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC144NLQ6NUI1 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC144NLQ6NUI1 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC144NLQ6NUI1 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC144NLQ6NUI1 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC144NLQ6NUI1 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC144NLQ6NUI1 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC144NLQ6NUI1 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC144NLQ6NUI1 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC144NLQ6NUI1 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC144NLQ6NUI1 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC144NLQ6NUI1 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC144NLQ6NUI1 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC144NLQ6NUI1 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC144NLQ6NUI1 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CCDC144NLQ6NUI1 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CCDC144NLQ6NUI1 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC144NLQ6NUI1 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC144NLQ6NUI1 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CCDC144NLQ6NUI1 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC144NLQ6NUI1 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC144NLQ6NUI1 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC144NLQ6NUI1 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC144NLQ6NUI1 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC144NLQ6NUI1 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC144NLQ6NUI1 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC144NLQ6NUI1 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC144NLQ6NUI1 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC144NLQ6NUI1 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC144NLQ6NUI1 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC144NLQ6NUI1 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC144NLQ6NUI1 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC144NLQ6NUI1 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC144NLQ6NUI1 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC144NLQ6NUI1 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC144NLQ6NUI1 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC144NLQ6NUI1 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC144NLQ6NUI1 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC144NLQ6NUI1 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC144NLQ6NUI1 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC144NLQ6NUI1 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC144NLQ6NUI1 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC144NLQ6NUI1 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC144NLQ6NUI1 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC144NLQ6NUI1 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC144NLQ6NUI1 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC144NLQ6NUI1 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC144NLQ6NUI1 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC144NLQ6NUI1 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC144NLQ6NUI1 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC144NLQ6NUI1 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC144NLQ6NUI1 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC144NLQ6NUI1 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC144NLQ6NUI1 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC144NLQ6NUI1 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC144NLQ6NUI1 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC144NLQ6NUI1 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC144NLQ6NUI1 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC144NLQ6NUI1 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC144NLQ6NUI1 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CCDC144NLQ6NUI1 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC144NLQ6NUI1 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC144NLQ6NUI1 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC144NLQ6NUI1 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC144NLQ6NUI1 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC144NLQ6NUI1 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC144NLQ6NUI1 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC144NLQ6NUI1 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CCDC144NLQ6NUI1 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms