Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TDRD12Q587J7 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TDRD12Q587J7 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TDRD12Q587J7 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TDRD12Q587J7 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TDRD12Q587J7 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TDRD12Q587J7 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TDRD12Q587J7 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TDRD12Q587J7 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TDRD12Q587J7 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TDRD12Q587J7 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TDRD12Q587J7 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TDRD12Q587J7 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TDRD12Q587J7 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TDRD12Q587J7 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TDRD12Q587J7 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TDRD12Q587J7 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TDRD12Q587J7 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TDRD12Q587J7 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TDRD12Q587J7 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TDRD12Q587J7 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TDRD12Q587J7 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TDRD12Q587J7 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TDRD12Q587J7 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TDRD12Q587J7 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TDRD12Q587J7 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TDRD12Q587J7 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TDRD12Q587J7 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TDRD12Q587J7 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TDRD12Q587J7 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TDRD12Q587J7 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TDRD12Q587J7 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TDRD12Q587J7 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TDRD12Q587J7 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TDRD12Q587J7 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TDRD12Q587J7 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TDRD12Q587J7 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TDRD12Q587J7 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TDRD12Q587J7 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TDRD12Q587J7 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TDRD12Q587J7 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TDRD12Q587J7 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TDRD12Q587J7 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TDRD12Q587J7 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TDRD12Q587J7 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TDRD12Q587J7 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TDRD12Q587J7 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TDRD12Q587J7 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TDRD12Q587J7 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TDRD12Q587J7 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TDRD12Q587J7 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TDRD12Q587J7 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TDRD12Q587J7 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TDRD12Q587J7 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TDRD12Q587J7 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TDRD12Q587J7 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TDRD12Q587J7 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TDRD12Q587J7 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TDRD12Q587J7 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TDRD12Q587J7 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TDRD12Q587J7 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TDRD12Q587J7 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TDRD12Q587J7 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TDRD12Q587J7 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TDRD12Q587J7 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TDRD12Q587J7 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TDRD12Q587J7 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TDRD12Q587J7 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TDRD12Q587J7 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TDRD12Q587J7 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TDRD12Q587J7 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TDRD12Q587J7 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TDRD12Q587J7 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TDRD12Q587J7 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TDRD12Q587J7 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TDRD12Q587J7 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TDRD12Q587J7 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TDRD12Q587J7 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TDRD12Q587J7 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TDRD12Q587J7 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TDRD12Q587J7 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TDRD12Q587J7 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TDRD12Q587J7 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TDRD12Q587J7 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TDRD12Q587J7 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TDRD12Q587J7 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TDRD12Q587J7 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TDRD12Q587J7 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TDRD12Q587J7 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TDRD12Q587J7 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TDRD12Q587J7 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TDRD12Q587J7 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TDRD12Q587J7 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TDRD12Q587J7 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TDRD12Q587J7 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TDRD12Q587J7 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TDRD12Q587J7 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TDRD12Q587J7 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TDRD12Q587J7 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TDRD12Q587J7 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms