Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC93Q567U6 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC93Q567U6 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC93Q567U6 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC93Q567U6 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC93Q567U6 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC93Q567U6 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC93Q567U6 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC93Q567U6 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC93Q567U6 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC93Q567U6 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC93Q567U6 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC93Q567U6 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC93Q567U6 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC93Q567U6 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC93Q567U6 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC93Q567U6 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC93Q567U6 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC93Q567U6 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC93Q567U6 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC93Q567U6 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC93Q567U6 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC93Q567U6 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC93Q567U6 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC93Q567U6 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC93Q567U6 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC93Q567U6 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC93Q567U6 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC93Q567U6 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC93Q567U6 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC93Q567U6 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC93Q567U6 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC93Q567U6 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC93Q567U6 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC93Q567U6 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC93Q567U6 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC93Q567U6 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC93Q567U6 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC93Q567U6 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC93Q567U6 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC93Q567U6 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC93Q567U6 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC93Q567U6 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC93Q567U6 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC93Q567U6 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC93Q567U6 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC93Q567U6 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC93Q567U6 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC93Q567U6 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC93Q567U6 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC93Q567U6 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC93Q567U6 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC93Q567U6 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC93Q567U6 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC93Q567U6 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC93Q567U6 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC93Q567U6 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC93Q567U6 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC93Q567U6 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC93Q567U6 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC93Q567U6 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC93Q567U6 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC93Q567U6 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC93Q567U6 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC93Q567U6 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC93Q567U6 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC93Q567U6 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC93Q567U6 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC93Q567U6 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC93Q567U6 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC93Q567U6 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC93Q567U6 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC93Q567U6 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC93Q567U6 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC93Q567U6 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC93Q567U6 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC93Q567U6 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC93Q567U6 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC93Q567U6 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC93Q567U6 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC93Q567U6 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC93Q567U6 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC93Q567U6 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC93Q567U6 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC93Q567U6 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC93Q567U6 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC93Q567U6 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC93Q567U6 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC93Q567U6 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC93Q567U6 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC93Q567U6 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC93Q567U6 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC93Q567U6 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC93Q567U6 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC93Q567U6 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC93Q567U6 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC93Q567U6 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC93Q567U6 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC93Q567U6 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC93Q567U6 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms