Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RAB6CQ53S08 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
RAB6CQ53S08 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
RAB6CQ53S08 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RAB6CQ53S08 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RAB6CQ53S08 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RAB6CQ53S08 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RAB6CQ53S08 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RAB6CQ53S08 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RAB6CQ53S08 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RAB6CQ53S08 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RAB6CQ53S08 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RAB6CQ53S08 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RAB6CQ53S08 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RAB6CQ53S08 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RAB6CQ53S08 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RAB6CQ53S08 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RAB6CQ53S08 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RAB6CQ53S08 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RAB6CQ53S08 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RAB6CQ53S08 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
RAB6CQ53S08 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
RAB6CQ53S08 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RAB6CQ53S08 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RAB6CQ53S08 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RAB6CQ53S08 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RAB6CQ53S08 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
RAB6CQ53S08 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RAB6CQ53S08 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RAB6CQ53S08 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RAB6CQ53S08 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RAB6CQ53S08 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RAB6CQ53S08 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RAB6CQ53S08 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RAB6CQ53S08 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RAB6CQ53S08 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RAB6CQ53S08 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RAB6CQ53S08 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAB6CQ53S08 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAB6CQ53S08 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAB6CQ53S08 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAB6CQ53S08 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAB6CQ53S08 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAB6CQ53S08 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAB6CQ53S08 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAB6CQ53S08 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAB6CQ53S08 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAB6CQ53S08 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAB6CQ53S08 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAB6CQ53S08 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAB6CQ53S08 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAB6CQ53S08 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAB6CQ53S08 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAB6CQ53S08 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAB6CQ53S08 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAB6CQ53S08 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAB6CQ53S08 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAB6CQ53S08 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAB6CQ53S08 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAB6CQ53S08 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAB6CQ53S08 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAB6CQ53S08 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
RAB6CQ53S08 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
RAB6CQ53S08 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAB6CQ53S08 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAB6CQ53S08 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAB6CQ53S08 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAB6CQ53S08 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAB6CQ53S08 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAB6CQ53S08 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAB6CQ53S08 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAB6CQ53S08 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAB6CQ53S08 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB6CQ53S08 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB6CQ53S08 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB6CQ53S08 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB6CQ53S08 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB6CQ53S08 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB6CQ53S08 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB6CQ53S08 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB6CQ53S08 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB6CQ53S08 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB6CQ53S08 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB6CQ53S08 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB6CQ53S08 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB6CQ53S08 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB6CQ53S08 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB6CQ53S08 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB6CQ53S08 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB6CQ53S08 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB6CQ53S08 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB6CQ53S08 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB6CQ53S08 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB6CQ53S08 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB6CQ53S08 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB6CQ53S08 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB6CQ53S08 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB6CQ53S08 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB6CQ53S08 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB6CQ53S08 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms