Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RFTN2Q52LD8 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RFTN2Q52LD8 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RFTN2Q52LD8 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RFTN2Q52LD8 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RFTN2Q52LD8 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
RFTN2Q52LD8 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
RFTN2Q52LD8 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RFTN2Q52LD8 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RFTN2Q52LD8 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RFTN2Q52LD8 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RFTN2Q52LD8 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RFTN2Q52LD8 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RFTN2Q52LD8 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RFTN2Q52LD8 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RFTN2Q52LD8 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RFTN2Q52LD8 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RFTN2Q52LD8 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RFTN2Q52LD8 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RFTN2Q52LD8 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RFTN2Q52LD8 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RFTN2Q52LD8 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RFTN2Q52LD8 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RFTN2Q52LD8 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RFTN2Q52LD8 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RFTN2Q52LD8 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RFTN2Q52LD8 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RFTN2Q52LD8 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RFTN2Q52LD8 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RFTN2Q52LD8 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RFTN2Q52LD8 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RFTN2Q52LD8 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RFTN2Q52LD8 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RFTN2Q52LD8 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RFTN2Q52LD8 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RFTN2Q52LD8 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RFTN2Q52LD8 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RFTN2Q52LD8 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RFTN2Q52LD8 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RFTN2Q52LD8 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RFTN2Q52LD8 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RFTN2Q52LD8 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RFTN2Q52LD8 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RFTN2Q52LD8 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RFTN2Q52LD8 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RFTN2Q52LD8 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RFTN2Q52LD8 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RFTN2Q52LD8 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RFTN2Q52LD8 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RFTN2Q52LD8 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RFTN2Q52LD8 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RFTN2Q52LD8 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RFTN2Q52LD8 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RFTN2Q52LD8 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RFTN2Q52LD8 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RFTN2Q52LD8 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RFTN2Q52LD8 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RFTN2Q52LD8 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RFTN2Q52LD8 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RFTN2Q52LD8 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RFTN2Q52LD8 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RFTN2Q52LD8 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RFTN2Q52LD8 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RFTN2Q52LD8 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RFTN2Q52LD8 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RFTN2Q52LD8 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RFTN2Q52LD8 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RFTN2Q52LD8 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RFTN2Q52LD8 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RFTN2Q52LD8 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RFTN2Q52LD8 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RFTN2Q52LD8 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RFTN2Q52LD8 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RFTN2Q52LD8 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RFTN2Q52LD8 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RFTN2Q52LD8 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RFTN2Q52LD8 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RFTN2Q52LD8 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RFTN2Q52LD8 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RFTN2Q52LD8 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RFTN2Q52LD8 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RFTN2Q52LD8 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RFTN2Q52LD8 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
RFTN2Q52LD8 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RFTN2Q52LD8 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RFTN2Q52LD8 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RFTN2Q52LD8 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RFTN2Q52LD8 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RFTN2Q52LD8 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RFTN2Q52LD8 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RFTN2Q52LD8 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RFTN2Q52LD8 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
RFTN2Q52LD8 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RFTN2Q52LD8 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RFTN2Q52LD8 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RFTN2Q52LD8 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RFTN2Q52LD8 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RFTN2Q52LD8 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RFTN2Q52LD8 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RFTN2Q52LD8 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms