Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC38Q502W7 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC38Q502W7 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC38Q502W7 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC38Q502W7 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC38Q502W7 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC38Q502W7 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC38Q502W7 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC38Q502W7 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC38Q502W7 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC38Q502W7 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC38Q502W7 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC38Q502W7 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC38Q502W7 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC38Q502W7 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC38Q502W7 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC38Q502W7 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC38Q502W7 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC38Q502W7 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC38Q502W7 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC38Q502W7 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC38Q502W7 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC38Q502W7 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CCDC38Q502W7 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CCDC38Q502W7 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CCDC38Q502W7 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CCDC38Q502W7 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC38Q502W7 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC38Q502W7 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC38Q502W7 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC38Q502W7 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC38Q502W7 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC38Q502W7 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC38Q502W7 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC38Q502W7 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC38Q502W7 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC38Q502W7 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC38Q502W7 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC38Q502W7 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC38Q502W7 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC38Q502W7 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC38Q502W7 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC38Q502W7 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC38Q502W7 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC38Q502W7 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC38Q502W7 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC38Q502W7 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC38Q502W7 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC38Q502W7 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC38Q502W7 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC38Q502W7 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC38Q502W7 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC38Q502W7 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC38Q502W7 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC38Q502W7 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC38Q502W7 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC38Q502W7 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC38Q502W7 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC38Q502W7 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC38Q502W7 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC38Q502W7 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC38Q502W7 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC38Q502W7 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC38Q502W7 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC38Q502W7 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC38Q502W7 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC38Q502W7 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC38Q502W7 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC38Q502W7 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC38Q502W7 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC38Q502W7 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC38Q502W7 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC38Q502W7 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC38Q502W7 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC38Q502W7 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC38Q502W7 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC38Q502W7 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC38Q502W7 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC38Q502W7 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC38Q502W7 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC38Q502W7 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC38Q502W7 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC38Q502W7 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC38Q502W7 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC38Q502W7 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC38Q502W7 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC38Q502W7 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC38Q502W7 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC38Q502W7 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC38Q502W7 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC38Q502W7 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC38Q502W7 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC38Q502W7 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC38Q502W7 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC38Q502W7 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC38Q502W7 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC38Q502W7 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC38Q502W7 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC38Q502W7 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC38Q502W7 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms