Protein–RNA interactions for Protein: Q3KP44

ANKRD55, Ankyrin repeat domain-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD55Q3KP44 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms