Protein–RNA interactions for Protein: Q2M238

RRN3P1, Putative RRN3-like protein RRN3P1, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1Q2M238 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RRN3P1Q2M238 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RRN3P1Q2M238 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RRN3P1Q2M238 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RRN3P1Q2M238 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RRN3P1Q2M238 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RRN3P1Q2M238 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RRN3P1Q2M238 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RRN3P1Q2M238 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RRN3P1Q2M238 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RRN3P1Q2M238 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RRN3P1Q2M238 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RRN3P1Q2M238 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
RRN3P1Q2M238 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RRN3P1Q2M238 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RRN3P1Q2M238 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RRN3P1Q2M238 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RRN3P1Q2M238 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RRN3P1Q2M238 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RRN3P1Q2M238 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RRN3P1Q2M238 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RRN3P1Q2M238 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RRN3P1Q2M238 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RRN3P1Q2M238 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RRN3P1Q2M238 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
RRN3P1Q2M238 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RRN3P1Q2M238 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RRN3P1Q2M238 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RRN3P1Q2M238 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RRN3P1Q2M238 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RRN3P1Q2M238 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RRN3P1Q2M238 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
RRN3P1Q2M238 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RRN3P1Q2M238 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
RRN3P1Q2M238 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RRN3P1Q2M238 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RRN3P1Q2M238 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RRN3P1Q2M238 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RRN3P1Q2M238 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RRN3P1Q2M238 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RRN3P1Q2M238 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RRN3P1Q2M238 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RRN3P1Q2M238 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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RRN3P1Q2M238 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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RRN3P1Q2M238 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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RRN3P1Q2M238 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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RRN3P1Q2M238 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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RRN3P1Q2M238 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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