Protein–RNA interactions for Protein: Q29983

MICA, MHC class I polypeptide-related sequence A, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MICAQ29983 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MICAQ29983 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MICAQ29983 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MICAQ29983 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MICAQ29983 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MICAQ29983 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MICAQ29983 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
MICAQ29983 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
MICAQ29983 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MICAQ29983 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MICAQ29983 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
MICAQ29983 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
MICAQ29983 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
MICAQ29983 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
MICAQ29983 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MICAQ29983 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
MICAQ29983 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MICAQ29983 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MICAQ29983 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MICAQ29983 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MICAQ29983 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MICAQ29983 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MICAQ29983 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MICAQ29983 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MICAQ29983 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MICAQ29983 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MICAQ29983 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MICAQ29983 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MICAQ29983 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MICAQ29983 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MICAQ29983 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MICAQ29983 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MICAQ29983 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MICAQ29983 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MICAQ29983 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MICAQ29983 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MICAQ29983 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MICAQ29983 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MICAQ29983 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MICAQ29983 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MICAQ29983 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MICAQ29983 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MICAQ29983 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MICAQ29983 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MICAQ29983 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MICAQ29983 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MICAQ29983 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
MICAQ29983 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MICAQ29983 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MICAQ29983 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MICAQ29983 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MICAQ29983 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MICAQ29983 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MICAQ29983 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MICAQ29983 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MICAQ29983 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MICAQ29983 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MICAQ29983 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
MICAQ29983 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MICAQ29983 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MICAQ29983 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MICAQ29983 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MICAQ29983 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MICAQ29983 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MICAQ29983 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MICAQ29983 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MICAQ29983 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MICAQ29983 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MICAQ29983 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MICAQ29983 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MICAQ29983 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MICAQ29983 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MICAQ29983 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MICAQ29983 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MICAQ29983 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MICAQ29983 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MICAQ29983 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MICAQ29983 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MICAQ29983 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MICAQ29983 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MICAQ29983 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MICAQ29983 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MICAQ29983 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MICAQ29983 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MICAQ29983 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MICAQ29983 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MICAQ29983 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MICAQ29983 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MICAQ29983 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MICAQ29983 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MICAQ29983 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MICAQ29983 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MICAQ29983 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MICAQ29983 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MICAQ29983 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MICAQ29983 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MICAQ29983 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MICAQ29983 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MICAQ29983 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MICAQ29983 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms