Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q1T7F1 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q1T7F1 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q1T7F1 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q1T7F1 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q1T7F1 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q1T7F1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q1T7F1 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q1T7F1 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q1T7F1 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q1T7F1 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q1T7F1 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q1T7F1 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q1T7F1 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q1T7F1 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q1T7F1 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q1T7F1 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Q1T7F1 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q1T7F1 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q1T7F1 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q1T7F1 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q1T7F1 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q1T7F1 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q1T7F1 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q1T7F1 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q1T7F1 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q1T7F1 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q1T7F1 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q1T7F1 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q1T7F1 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q1T7F1 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Q1T7F1 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Q1T7F1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Q1T7F1 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Q1T7F1 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
Q1T7F1 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Q1T7F1 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Q1T7F1 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Q1T7F1 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Q1T7F1 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Q1T7F1 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Q1T7F1 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Q1T7F1 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Q1T7F1 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Q1T7F1 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Q1T7F1 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Q1T7F1 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Q1T7F1 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Q1T7F1 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Q1T7F1 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Q1T7F1 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q1T7F1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q1T7F1 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Q1T7F1 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Q1T7F1 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Q1T7F1 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q1T7F1 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q1T7F1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q1T7F1 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q1T7F1 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q1T7F1 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q1T7F1 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Q1T7F1 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q1T7F1 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q1T7F1 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q1T7F1 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q1T7F1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q1T7F1 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q1T7F1 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q1T7F1 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q1T7F1 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q1T7F1 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q1T7F1 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q1T7F1 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q1T7F1 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q1T7F1 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q1T7F1 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q1T7F1 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q1T7F1 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q1T7F1 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q1T7F1 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q1T7F1 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q1T7F1 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q1T7F1 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q1T7F1 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q1T7F1 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q1T7F1 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q1T7F1 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q1T7F1 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q1T7F1 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q1T7F1 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q1T7F1 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q1T7F1 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q1T7F1 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q1T7F1 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q1T7F1 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q1T7F1 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q1T7F1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q1T7F1 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q1T7F1 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
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