Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IMPG1Q17R60 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IMPG1Q17R60 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IMPG1Q17R60 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IMPG1Q17R60 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IMPG1Q17R60 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
IMPG1Q17R60 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IMPG1Q17R60 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
IMPG1Q17R60 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IMPG1Q17R60 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IMPG1Q17R60 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IMPG1Q17R60 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IMPG1Q17R60 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IMPG1Q17R60 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
IMPG1Q17R60 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IMPG1Q17R60 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IMPG1Q17R60 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IMPG1Q17R60 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IMPG1Q17R60 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IMPG1Q17R60 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IMPG1Q17R60 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IMPG1Q17R60 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IMPG1Q17R60 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IMPG1Q17R60 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IMPG1Q17R60 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IMPG1Q17R60 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IMPG1Q17R60 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IMPG1Q17R60 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IMPG1Q17R60 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IMPG1Q17R60 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IMPG1Q17R60 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IMPG1Q17R60 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IMPG1Q17R60 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IMPG1Q17R60 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
IMPG1Q17R60 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
IMPG1Q17R60 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IMPG1Q17R60 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IMPG1Q17R60 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IMPG1Q17R60 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IMPG1Q17R60 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IMPG1Q17R60 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IMPG1Q17R60 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IMPG1Q17R60 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IMPG1Q17R60 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IMPG1Q17R60 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IMPG1Q17R60 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IMPG1Q17R60 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
IMPG1Q17R60 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
IMPG1Q17R60 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
IMPG1Q17R60 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
IMPG1Q17R60 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
IMPG1Q17R60 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
IMPG1Q17R60 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
IMPG1Q17R60 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
IMPG1Q17R60 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
IMPG1Q17R60 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
IMPG1Q17R60 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
IMPG1Q17R60 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms