Protein–RNA interactions for Protein: Q16821

PPP1R3A, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 3A, humanhuman

Predictions only

Length 1,122 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R3AQ16821 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PPP1R3AQ16821 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PPP1R3AQ16821 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PPP1R3AQ16821 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PPP1R3AQ16821 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PPP1R3AQ16821 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PPP1R3AQ16821 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PPP1R3AQ16821 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PPP1R3AQ16821 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PPP1R3AQ16821 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PPP1R3AQ16821 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PPP1R3AQ16821 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PPP1R3AQ16821 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PPP1R3AQ16821 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PPP1R3AQ16821 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PPP1R3AQ16821 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PPP1R3AQ16821 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PPP1R3AQ16821 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PPP1R3AQ16821 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PPP1R3AQ16821 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PPP1R3AQ16821 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PPP1R3AQ16821 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PPP1R3AQ16821 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PPP1R3AQ16821 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PPP1R3AQ16821 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PPP1R3AQ16821 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PPP1R3AQ16821 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PPP1R3AQ16821 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PPP1R3AQ16821 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PPP1R3AQ16821 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PPP1R3AQ16821 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PPP1R3AQ16821 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PPP1R3AQ16821 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PPP1R3AQ16821 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PPP1R3AQ16821 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PPP1R3AQ16821 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PPP1R3AQ16821 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PPP1R3AQ16821 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PPP1R3AQ16821 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PPP1R3AQ16821 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PPP1R3AQ16821 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PPP1R3AQ16821 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PPP1R3AQ16821 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PPP1R3AQ16821 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PPP1R3AQ16821 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PPP1R3AQ16821 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PPP1R3AQ16821 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PPP1R3AQ16821 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PPP1R3AQ16821 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PPP1R3AQ16821 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PPP1R3AQ16821 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PPP1R3AQ16821 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PPP1R3AQ16821 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PPP1R3AQ16821 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PPP1R3AQ16821 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PPP1R3AQ16821 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PPP1R3AQ16821 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PPP1R3AQ16821 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PPP1R3AQ16821 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PPP1R3AQ16821 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PPP1R3AQ16821 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PPP1R3AQ16821 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PPP1R3AQ16821 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PPP1R3AQ16821 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PPP1R3AQ16821 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PPP1R3AQ16821 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PPP1R3AQ16821 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PPP1R3AQ16821 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PPP1R3AQ16821 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PPP1R3AQ16821 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PPP1R3AQ16821 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PPP1R3AQ16821 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PPP1R3AQ16821 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PPP1R3AQ16821 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PPP1R3AQ16821 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PPP1R3AQ16821 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PPP1R3AQ16821 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PPP1R3AQ16821 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PPP1R3AQ16821 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PPP1R3AQ16821 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PPP1R3AQ16821 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PPP1R3AQ16821 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PPP1R3AQ16821 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PPP1R3AQ16821 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PPP1R3AQ16821 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PPP1R3AQ16821 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PPP1R3AQ16821 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PPP1R3AQ16821 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PPP1R3AQ16821 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PPP1R3AQ16821 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PPP1R3AQ16821 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PPP1R3AQ16821 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PPP1R3AQ16821 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PPP1R3AQ16821 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PPP1R3AQ16821 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PPP1R3AQ16821 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PPP1R3AQ16821 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PPP1R3AQ16821 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PPP1R3AQ16821 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PPP1R3AQ16821 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
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