Protein–RNA interactions for Protein: Q16570

ACKR1, Atypical chemokine receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACKR1Q16570 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACKR1Q16570 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACKR1Q16570 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACKR1Q16570 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACKR1Q16570 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACKR1Q16570 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACKR1Q16570 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACKR1Q16570 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACKR1Q16570 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACKR1Q16570 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACKR1Q16570 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACKR1Q16570 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACKR1Q16570 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACKR1Q16570 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACKR1Q16570 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACKR1Q16570 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACKR1Q16570 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACKR1Q16570 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACKR1Q16570 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACKR1Q16570 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACKR1Q16570 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACKR1Q16570 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACKR1Q16570 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACKR1Q16570 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACKR1Q16570 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACKR1Q16570 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACKR1Q16570 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ACKR1Q16570 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACKR1Q16570 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ACKR1Q16570 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACKR1Q16570 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACKR1Q16570 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACKR1Q16570 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACKR1Q16570 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACKR1Q16570 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACKR1Q16570 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACKR1Q16570 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ACKR1Q16570 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACKR1Q16570 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACKR1Q16570 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACKR1Q16570 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACKR1Q16570 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACKR1Q16570 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ACKR1Q16570 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACKR1Q16570 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACKR1Q16570 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACKR1Q16570 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACKR1Q16570 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACKR1Q16570 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACKR1Q16570 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACKR1Q16570 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACKR1Q16570 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACKR1Q16570 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACKR1Q16570 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACKR1Q16570 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACKR1Q16570 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACKR1Q16570 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACKR1Q16570 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACKR1Q16570 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACKR1Q16570 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACKR1Q16570 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ACKR1Q16570 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACKR1Q16570 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACKR1Q16570 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACKR1Q16570 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACKR1Q16570 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACKR1Q16570 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACKR1Q16570 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACKR1Q16570 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACKR1Q16570 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACKR1Q16570 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACKR1Q16570 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACKR1Q16570 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACKR1Q16570 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACKR1Q16570 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACKR1Q16570 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACKR1Q16570 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACKR1Q16570 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACKR1Q16570 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACKR1Q16570 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACKR1Q16570 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACKR1Q16570 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACKR1Q16570 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACKR1Q16570 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACKR1Q16570 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ACKR1Q16570 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACKR1Q16570 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACKR1Q16570 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACKR1Q16570 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACKR1Q16570 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACKR1Q16570 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACKR1Q16570 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACKR1Q16570 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACKR1Q16570 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACKR1Q16570 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACKR1Q16570 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACKR1Q16570 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ACKR1Q16570 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACKR1Q16570 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACKR1Q16570 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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