Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CNGA3Q16281 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CNGA3Q16281 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CNGA3Q16281 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CNGA3Q16281 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CNGA3Q16281 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CNGA3Q16281 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CNGA3Q16281 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CNGA3Q16281 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CNGA3Q16281 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CNGA3Q16281 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CNGA3Q16281 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CNGA3Q16281 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CNGA3Q16281 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CNGA3Q16281 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CNGA3Q16281 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CNGA3Q16281 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CNGA3Q16281 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CNGA3Q16281 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CNGA3Q16281 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CNGA3Q16281 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CNGA3Q16281 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CNGA3Q16281 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CNGA3Q16281 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CNGA3Q16281 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CNGA3Q16281 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CNGA3Q16281 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CNGA3Q16281 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CNGA3Q16281 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CNGA3Q16281 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CNGA3Q16281 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CNGA3Q16281 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CNGA3Q16281 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CNGA3Q16281 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CNGA3Q16281 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CNGA3Q16281 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CNGA3Q16281 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CNGA3Q16281 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CNGA3Q16281 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CNGA3Q16281 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CNGA3Q16281 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CNGA3Q16281 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CNGA3Q16281 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CNGA3Q16281 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CNGA3Q16281 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CNGA3Q16281 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CNGA3Q16281 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CNGA3Q16281 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CNGA3Q16281 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CNGA3Q16281 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CNGA3Q16281 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CNGA3Q16281 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CNGA3Q16281 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CNGA3Q16281 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CNGA3Q16281 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CNGA3Q16281 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CNGA3Q16281 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CNGA3Q16281 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CNGA3Q16281 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CNGA3Q16281 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CNGA3Q16281 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CNGA3Q16281 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CNGA3Q16281 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CNGA3Q16281 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CNGA3Q16281 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CNGA3Q16281 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CNGA3Q16281 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CNGA3Q16281 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CNGA3Q16281 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CNGA3Q16281 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CNGA3Q16281 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CNGA3Q16281 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CNGA3Q16281 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CNGA3Q16281 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CNGA3Q16281 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CNGA3Q16281 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CNGA3Q16281 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CNGA3Q16281 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CNGA3Q16281 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CNGA3Q16281 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CNGA3Q16281 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CNGA3Q16281 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CNGA3Q16281 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CNGA3Q16281 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CNGA3Q16281 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CNGA3Q16281 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CNGA3Q16281 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CNGA3Q16281 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CNGA3Q16281 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CNGA3Q16281 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CNGA3Q16281 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CNGA3Q16281 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CNGA3Q16281 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CNGA3Q16281 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CNGA3Q16281 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CNGA3Q16281 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CNGA3Q16281 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CNGA3Q16281 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CNGA3Q16281 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CNGA3Q16281 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
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