Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCDC6Q16204 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCDC6Q16204 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCDC6Q16204 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCDC6Q16204 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCDC6Q16204 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCDC6Q16204 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC6Q16204 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC6Q16204 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC6Q16204 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC6Q16204 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC6Q16204 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC6Q16204 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC6Q16204 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC6Q16204 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC6Q16204 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC6Q16204 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC6Q16204 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC6Q16204 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC6Q16204 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC6Q16204 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC6Q16204 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC6Q16204 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC6Q16204 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC6Q16204 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC6Q16204 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC6Q16204 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC6Q16204 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC6Q16204 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC6Q16204 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC6Q16204 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC6Q16204 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC6Q16204 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC6Q16204 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC6Q16204 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC6Q16204 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC6Q16204 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC6Q16204 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC6Q16204 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC6Q16204 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC6Q16204 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC6Q16204 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC6Q16204 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC6Q16204 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC6Q16204 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC6Q16204 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC6Q16204 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC6Q16204 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC6Q16204 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC6Q16204 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC6Q16204 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC6Q16204 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC6Q16204 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC6Q16204 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC6Q16204 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC6Q16204 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC6Q16204 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC6Q16204 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC6Q16204 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC6Q16204 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC6Q16204 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC6Q16204 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC6Q16204 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC6Q16204 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC6Q16204 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC6Q16204 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC6Q16204 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC6Q16204 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC6Q16204 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC6Q16204 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC6Q16204 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC6Q16204 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC6Q16204 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC6Q16204 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC6Q16204 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC6Q16204 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC6Q16204 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC6Q16204 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC6Q16204 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC6Q16204 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC6Q16204 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC6Q16204 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC6Q16204 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC6Q16204 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC6Q16204 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC6Q16204 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC6Q16204 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC6Q16204 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC6Q16204 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC6Q16204 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC6Q16204 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC6Q16204 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC6Q16204 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC6Q16204 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC6Q16204 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC6Q16204 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC6Q16204 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC6Q16204 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC6Q16204 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC6Q16204 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
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