Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GRIK4Q16099 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GRIK4Q16099 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GRIK4Q16099 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GRIK4Q16099 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GRIK4Q16099 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GRIK4Q16099 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GRIK4Q16099 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GRIK4Q16099 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GRIK4Q16099 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GRIK4Q16099 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GRIK4Q16099 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GRIK4Q16099 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GRIK4Q16099 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GRIK4Q16099 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GRIK4Q16099 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
GRIK4Q16099 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
GRIK4Q16099 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GRIK4Q16099 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GRIK4Q16099 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GRIK4Q16099 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GRIK4Q16099 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GRIK4Q16099 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GRIK4Q16099 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GRIK4Q16099 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GRIK4Q16099 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GRIK4Q16099 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GRIK4Q16099 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GRIK4Q16099 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GRIK4Q16099 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GRIK4Q16099 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GRIK4Q16099 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GRIK4Q16099 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GRIK4Q16099 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GRIK4Q16099 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GRIK4Q16099 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GRIK4Q16099 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GRIK4Q16099 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GRIK4Q16099 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GRIK4Q16099 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GRIK4Q16099 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GRIK4Q16099 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
GRIK4Q16099 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GRIK4Q16099 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GRIK4Q16099 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GRIK4Q16099 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GRIK4Q16099 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GRIK4Q16099 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GRIK4Q16099 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GRIK4Q16099 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GRIK4Q16099 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GRIK4Q16099 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GRIK4Q16099 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GRIK4Q16099 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GRIK4Q16099 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GRIK4Q16099 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GRIK4Q16099 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GRIK4Q16099 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GRIK4Q16099 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GRIK4Q16099 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GRIK4Q16099 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GRIK4Q16099 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GRIK4Q16099 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GRIK4Q16099 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GRIK4Q16099 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GRIK4Q16099 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GRIK4Q16099 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GRIK4Q16099 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GRIK4Q16099 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GRIK4Q16099 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GRIK4Q16099 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GRIK4Q16099 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
GRIK4Q16099 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GRIK4Q16099 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GRIK4Q16099 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GRIK4Q16099 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GRIK4Q16099 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GRIK4Q16099 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
GRIK4Q16099 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
GRIK4Q16099 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GRIK4Q16099 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GRIK4Q16099 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
GRIK4Q16099 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GRIK4Q16099 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GRIK4Q16099 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GRIK4Q16099 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GRIK4Q16099 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GRIK4Q16099 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GRIK4Q16099 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GRIK4Q16099 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GRIK4Q16099 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GRIK4Q16099 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GRIK4Q16099 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GRIK4Q16099 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GRIK4Q16099 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GRIK4Q16099 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GRIK4Q16099 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GRIK4Q16099 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GRIK4Q16099 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GRIK4Q16099 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms