Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
VPS72Q15906 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VPS72Q15906 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
VPS72Q15906 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
VPS72Q15906 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VPS72Q15906 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VPS72Q15906 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
VPS72Q15906 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VPS72Q15906 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VPS72Q15906 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
VPS72Q15906 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
VPS72Q15906 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VPS72Q15906 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VPS72Q15906 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VPS72Q15906 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VPS72Q15906 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
VPS72Q15906 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VPS72Q15906 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VPS72Q15906 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VPS72Q15906 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VPS72Q15906 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VPS72Q15906 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VPS72Q15906 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
VPS72Q15906 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
VPS72Q15906 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
VPS72Q15906 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
VPS72Q15906 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
VPS72Q15906 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
VPS72Q15906 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VPS72Q15906 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VPS72Q15906 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VPS72Q15906 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
VPS72Q15906 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
VPS72Q15906 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
VPS72Q15906 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VPS72Q15906 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VPS72Q15906 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VPS72Q15906 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VPS72Q15906 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
VPS72Q15906 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VPS72Q15906 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VPS72Q15906 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
VPS72Q15906 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
VPS72Q15906 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VPS72Q15906 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
VPS72Q15906 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
VPS72Q15906 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
VPS72Q15906 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VPS72Q15906 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VPS72Q15906 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VPS72Q15906 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VPS72Q15906 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
VPS72Q15906 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
VPS72Q15906 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VPS72Q15906 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VPS72Q15906 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VPS72Q15906 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
VPS72Q15906 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
VPS72Q15906 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
VPS72Q15906 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
VPS72Q15906 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VPS72Q15906 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
VPS72Q15906 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VPS72Q15906 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VPS72Q15906 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
VPS72Q15906 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VPS72Q15906 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VPS72Q15906 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
VPS72Q15906 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VPS72Q15906 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
VPS72Q15906 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VPS72Q15906 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
VPS72Q15906 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
VPS72Q15906 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VPS72Q15906 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
VPS72Q15906 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
VPS72Q15906 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
VPS72Q15906 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
VPS72Q15906 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
VPS72Q15906 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
VPS72Q15906 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
VPS72Q15906 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
VPS72Q15906 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VPS72Q15906 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VPS72Q15906 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VPS72Q15906 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VPS72Q15906 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
VPS72Q15906 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VPS72Q15906 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VPS72Q15906 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VPS72Q15906 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VPS72Q15906 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VPS72Q15906 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VPS72Q15906 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VPS72Q15906 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
VPS72Q15906 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VPS72Q15906 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VPS72Q15906 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VPS72Q15906 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VPS72Q15906 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
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