Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
USF2Q15853 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
USF2Q15853 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
USF2Q15853 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
USF2Q15853 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
USF2Q15853 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
USF2Q15853 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
USF2Q15853 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
USF2Q15853 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.02■□□□□ -0
USF2Q15853 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
USF2Q15853 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
USF2Q15853 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
USF2Q15853 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
USF2Q15853 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
USF2Q15853 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
USF2Q15853 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
USF2Q15853 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
USF2Q15853 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
USF2Q15853 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
USF2Q15853 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
USF2Q15853 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
USF2Q15853 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
USF2Q15853 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
USF2Q15853 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
USF2Q15853 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
USF2Q15853 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
USF2Q15853 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
USF2Q15853 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
USF2Q15853 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC15.02■□□□□ -0
USF2Q15853 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
USF2Q15853 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
USF2Q15853 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
USF2Q15853 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
USF2Q15853 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC15.02■□□□□ -0
USF2Q15853 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
USF2Q15853 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
USF2Q15853 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
USF2Q15853 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
USF2Q15853 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
USF2Q15853 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
USF2Q15853 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
USF2Q15853 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
USF2Q15853 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
USF2Q15853 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
USF2Q15853 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
USF2Q15853 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
USF2Q15853 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
USF2Q15853 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
USF2Q15853 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
USF2Q15853 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
USF2Q15853 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
USF2Q15853 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
USF2Q15853 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
USF2Q15853 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
USF2Q15853 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
USF2Q15853 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
USF2Q15853 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
USF2Q15853 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
USF2Q15853 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
USF2Q15853 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
USF2Q15853 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
USF2Q15853 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
USF2Q15853 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
USF2Q15853 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
USF2Q15853 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
USF2Q15853 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
USF2Q15853 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
USF2Q15853 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
USF2Q15853 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
USF2Q15853 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
USF2Q15853 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
USF2Q15853 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
USF2Q15853 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
USF2Q15853 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
USF2Q15853 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
USF2Q15853 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
USF2Q15853 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
USF2Q15853 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
USF2Q15853 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
USF2Q15853 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
USF2Q15853 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
USF2Q15853 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
USF2Q15853 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
USF2Q15853 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
USF2Q15853 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
USF2Q15853 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
USF2Q15853 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
USF2Q15853 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
USF2Q15853 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
USF2Q15853 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
USF2Q15853 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
USF2Q15853 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
USF2Q15853 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
USF2Q15853 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
USF2Q15853 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC15□□□□□ -0.01
USF2Q15853 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
USF2Q15853 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
USF2Q15853 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
USF2Q15853 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
USF2Q15853 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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