Protein–RNA interactions for Protein: Q15120

PDK3, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 3, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK3Q15120 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PDK3Q15120 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PDK3Q15120 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PDK3Q15120 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PDK3Q15120 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PDK3Q15120 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PDK3Q15120 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDK3Q15120 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDK3Q15120 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDK3Q15120 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDK3Q15120 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PDK3Q15120 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDK3Q15120 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDK3Q15120 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDK3Q15120 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDK3Q15120 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDK3Q15120 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDK3Q15120 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDK3Q15120 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDK3Q15120 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDK3Q15120 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDK3Q15120 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDK3Q15120 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDK3Q15120 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDK3Q15120 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDK3Q15120 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDK3Q15120 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDK3Q15120 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDK3Q15120 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDK3Q15120 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PDK3Q15120 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDK3Q15120 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDK3Q15120 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDK3Q15120 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDK3Q15120 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDK3Q15120 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDK3Q15120 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDK3Q15120 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDK3Q15120 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDK3Q15120 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDK3Q15120 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDK3Q15120 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDK3Q15120 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDK3Q15120 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDK3Q15120 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDK3Q15120 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDK3Q15120 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDK3Q15120 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDK3Q15120 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDK3Q15120 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDK3Q15120 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
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