Protein–RNA interactions for Protein: Q14990

ODF1, Outer dense fiber protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF1Q14990 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 ATP5L2-201ENST00000505920 799 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms