Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHD4Q14839 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHD4Q14839 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHD4Q14839 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHD4Q14839 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHD4Q14839 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHD4Q14839 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHD4Q14839 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHD4Q14839 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHD4Q14839 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHD4Q14839 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHD4Q14839 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHD4Q14839 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHD4Q14839 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHD4Q14839 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHD4Q14839 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHD4Q14839 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHD4Q14839 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHD4Q14839 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHD4Q14839 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CHD4Q14839 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
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CHD4Q14839 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHD4Q14839 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHD4Q14839 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHD4Q14839 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHD4Q14839 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHD4Q14839 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
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CHD4Q14839 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
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CHD4Q14839 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHD4Q14839 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHD4Q14839 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
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CHD4Q14839 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
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CHD4Q14839 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHD4Q14839 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHD4Q14839 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
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CHD4Q14839 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
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CHD4Q14839 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
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CHD4Q14839 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
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CHD4Q14839 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHD4Q14839 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
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CHD4Q14839 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
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CHD4Q14839 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
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CHD4Q14839 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
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CHD4Q14839 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.28
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CHD4Q14839 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHD4Q14839 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHD4Q14839 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHD4Q14839 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHD4Q14839 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHD4Q14839 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHD4Q14839 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHD4Q14839 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHD4Q14839 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHD4Q14839 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHD4Q14839 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CHD4Q14839 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHD4Q14839 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHD4Q14839 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHD4Q14839 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHD4Q14839 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHD4Q14839 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHD4Q14839 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHD4Q14839 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
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